RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000543170.5

COPS7A-216, Transcript of COP9 signalosome subunit 7A, humanhuman

TSL 2

Gene COPS7A, Length 552 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COPS7A-216ENST00000543170 ETFDHQ16134 617 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SGCAQ16586 387 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SLC36A3Q495N2 470 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZFP1Q6P2D0 407 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SYT9Q86SS6 491 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 HIPK1Q86Z02 1210 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF584Q8IVC4 421 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 C10orf67Q8IYJ2 551 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC18Q8N456 261 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 OR4K13Q8NH42 304 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 TEX47Q8TBZ9 253 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 NMNAT3Q96T66 252 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 NUAK2Q9H093 628 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 FKBP7Q9Y680 259 aa15.95■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 PATE4P0C8F1 98 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 OSMP13725 252 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 PAX1P15863 534 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 PCBD1P61457 104 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 KHDRBS1Q07666 443 aaKnown RBP eCLIP15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 RAB39AQ14964 217 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 TESK1Q15569 626 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 FAHD1Q6P587 224 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZBTB46Q86UZ6 589 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 GLB1L2Q8IW92 636 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ATG16L2Q8NAA4 619 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 NPEPL1Q8NDH3 523 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SDR9C7Q8NEX9 313 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 OR52E2Q8NGJ4 325 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 OR4Q3Q8NH05 313 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 TMEM171Q8WVE6 324 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 MS4A3Q96HJ5 214 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 DDOQ99489 341 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 GABARAPL1Q9H0R8 117 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 CXorf56Q9H5V9 222 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 RNF121Q9H920 327 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 KLHL21Q9UJP4 597 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ATP23Q9Y6H3 246 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 PRRC2AP48634 2157 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 OTOGQ6ZRI0 2925 aa15.94■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 C12orf71A8MTZ7 269 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 H3BN98 237 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SNAP29O95721 258 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SOD3P08294 240 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 GAAP10253 952 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF35P13682 527 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF32P17041 273 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 PRKACGP22612 351 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 TTKP33981 857 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 GRK5P34947 590 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 LSM6P62312 80 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 PLP2Q04941 152 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 KCNMB1Q16558 191 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SLC35F1Q5T1Q4 408 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 OR6V1Q8N148 313 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 PARP8Q8N3A8 854 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SVOPLQ8N434 492 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 LRTOMTQ8WZ04 291 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 FBXO17Q96EF6 278 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 TRAF4Q9BUZ4 470 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF442Q9H7R0 627 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 CA10Q9NS85 328 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 KIF17Q9P2E2 1029 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 B9D1Q9UPM9 204 aa15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 OR6C68A6NDL8 312 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 DCTN6O00399 190 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ART1P52961 327 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 NKX6-1P78426 367 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 HSF2Q03933 536 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 GLO1Q04760 184 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 GABPB1Q06547 395 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 AQP6Q13520 282 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 AGAP6Q5VW22 663 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SLC27A4Q6P1M0 643 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 ZDHHC13Q8IUH4 622 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 FBXL14Q8N1E6 418 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 MUC15Q8N387 334 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SLC30A7Q8NEW0 376 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 PYDC1Q8WXC3 89 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 CENPNQ96H22 339 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 TSSK2Q96PF2 358 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 GSX2Q9BZM3 304 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 CMC2Q9NRP2 79 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 CBLN4Q9NTU7 201 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 LAMP3Q9UQV4 416 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa15.92■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 G3V2T6 193 aa15.91■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 OVOL3O00110 214 aa15.91■□□□□ 0.14
COPS7A-216ENST00000543170 SMPD2O60906 423 aa15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.2 ms