RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000538351.6

ZNF438-208, Transcript of zinc finger protein 438, human

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene ZNF438, Length 3,284 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
ZNF438-208	ENST00000538351	CHIT1	Q13231	466 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	HAGH	Q16775	308 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	PGGHG	Q32M88	737 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	MIDN	Q504T8	468 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	CACUL1	Q86Y37	369 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM183A	Q8IXX5	376 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	NKAIN3	Q8N8D7	197 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	OR1L6	Q8NGR2	347 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	OR4K15	Q8NH41	348 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	AUTS2	Q8WXX7	1259 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	RAB8B	Q92930	207 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	INTS14	Q96SY0	518 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	TPSD1	Q9BZJ3	242 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	CSNK1G1	Q9HCP0	422 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	NOX4	Q9NPH5	578 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	CACNG4	Q9UBN1	327 aa		7.16	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	TRBV11-1	A0A0K0K1C0	115 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	TSPAN2	O60636	221 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	PRAMEF4	O60810	478 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	NTN1	O95631	604 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	OPN1LW	P04000	364 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	GBA	P04062	536 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	PGA4	P0DJD7	388 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	PGA5	P0DJD9	388 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	TAGLN2	P37802	199 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	SNCA	P37840	140 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF616	Q08AN1	781 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	EBP	Q15125	230 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	NR0B2	Q15466	257 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	PRAMEF9	Q5VWM5	478 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	AWAT2	Q6E213	333 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	FAHD2B	Q6P2I3	314 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	HMGN2P46	Q86SG4	172 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	PLPP5	Q8NEB5	264 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	CASTOR1	Q8WTX7	329 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	MIB2	Q96AX9	1013 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	OTUB2	Q96DC9	234 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	NUDT11	Q96G61	164 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	FAHD2A	Q96GK7	314 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	LMF1	Q96S06	567 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	GFI1	Q99684	422 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	SMO	Q99835	787 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	GSKIP	Q9P0R6	139 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	STEAP1	Q9UHE8	339 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	TCFL5	Q9UL49	500 aa		7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351	MRPS33	Q9Y291	106 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.26
ZNF438-208	ENST00000538351		A0A087WUU8	490 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	IGKV6-21	A0A0C4DH24	114 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	C11orf97	A0A1B0GVM6	126 aa	Predicted RBP	7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	NKX6-3	A6NJ46	265 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	CHAT	P28329	748 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	TAS2R19	P59542	299 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	UBE2K	P61086	200 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	RAE1	P78406	368 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	MC1R	Q01726	317 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	ATP6V1F	Q16864	119 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	IQCJ	Q1A5X6	159 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	RPL7L1	Q6DKI1	246 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	ZNF836	Q6ZNA1	936 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	TEX26	Q8N6G2	289 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	OR9A4	Q8NGU2	314 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	SMPDL3A	Q92484	453 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC35B3	Q9H1N7	401 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	METTL8	Q9H825	291 aa	Known RBP	7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	RNF24	Q9Y225	148 aa		7.15	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	COL4A5	P29400	1685 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	ZBTB42	B2RXF5	422 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351		M0QYG6	137 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	CCL25	O15444	150 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	NME2P1	O60361	137 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	SNAI1	O95863	264 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	TK1	P04183	234 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	AMY2A	P04746	511 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	CTSH	P09668	335 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	OR5AC1	P0C628	307 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	PNLIP	P16233	465 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC6A9	P48067	706 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	TNFSF10	P50591	281 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	RAB7A	P51149	207 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	HMGCS2	P54868	508 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	SELENOT	P62341	195 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	SOHLH1	Q5JUK2	328 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351		Q5PR19	223 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	NXPE4	Q6UWF7	544 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	MEPCE	Q7L2J0	689 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	BHLHA9	Q7RTU4	235 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	LRRC70	Q7Z2Q7	622 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	DCXR	Q7Z4W1	244 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC35E3	Q7Z769	313 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	OR5T1	Q8NG75	326 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	SLC25A21	Q9BQT8	299 aa	Predicted RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	BOC	Q9BWV1	1114 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	TMEM30A	Q9NV96	361 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	HS3ST4	Q9Y661	456 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351		V9GY05	133 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	PDCD11	Q14690	1871 aa	Known RBP	7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351		A0A087WV62	115 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	CCDC85C	A6NKD9	419 aa		7.14	□□□□□ -1.27
ZNF438-208	ENST00000538351	MEIS3P2	A8K0S8	358 aa		7.14	□□□□□ -1.27

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.7 ms