RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000531867.1

PUM1-222, Transcript of pumilio RNA binding family member 1, human

TSL 4

Gene PUM1, Length 549 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PUM1-222	ENST00000531867	SLC1A2	P43004	574 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SOX2	P48431	317 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PDLIM4	P50479	330 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DVL1P1	P54792	670 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CDH11	P55287	796 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FOXG1	P55316	489 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DSCR4	P56555	118 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	RPL23A	P62750	156 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CDKL1	Q00532	357 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	IL23R	Q5VWK5	629 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF470	Q6ECI4	717 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ADNP2	Q6IQ32	1131 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867		Q6ZSR9	355 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FAM57B	Q71RH2	274 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SSX8	Q7RTT4	187 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PRUNE1	Q86TP1	453 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	UBQLNL	Q8IYU4	475 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PRR22	Q8IZ63	422 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MUC15	Q8N387	334 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR7G1	Q8NGA0	311 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DNAJA4	Q8WW22	397 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GGH	Q92820	318 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MTERF3	Q96E29	417 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	NRBF2	Q96F24	287 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SLC41A3	Q96GZ6	507 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CCDC42	Q96M95	316 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SIKE1	Q9BRV8	207 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LMF2	Q9BU23	707 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MS4A8	Q9BY19	250 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	POTEKP	Q9BYX7	375 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MYOZ1	Q9NP98	299 aa	Predicted RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PAK5	Q9P286	719 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	RHCG	Q9UBD6	479 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	IKZF3	Q9UKT9	509 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	NOSIP	Q9Y314	301 aa	Known RBP	4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	RAP2C	Q9Y3L5	183 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF337	Q9Y3M9	751 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	AP4B1	Q9Y6B7	739 aa		4.88	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FAM240B	A0A1B0GVZ2	78 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LOC390937	A0A1W2PQ73	354 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DPPA5	A6NC42	116 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR6C70	A6NIJ9	312 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ACOD1	A6NK06	481 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	WASHC1	A8K0Z3	465 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ACOX3	O15254	700 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PRAF2	O60831	178 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GMNN	O75496	209 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LY6H	O94772	140 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	NTN1	O95631	604 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TACSTD2	P09758	323 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PAICS	P22234	425 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MPZ	P25189	248 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GIF	P27352	417 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CDKN2D	P55273	166 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	HNRNPH2	P55795	449 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	P2RX3	P56373	397 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CLDN20	P56880	219 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CSNK2A1	P68400	391 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CBX1	P83916	185 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CDK16	Q00536	496 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ILF2	Q12905	390 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	PLA2G7	Q13093	441 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	UBE2V1	Q13404	147 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	NPTX1	Q15818	432 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DECR1	Q16698	335 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM44	Q2T9K0	475 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	GLYR1	Q49A26	553 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM35A	Q53FP2	167 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	C18orf63	Q68DL7	685 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF544	Q6NX49	715 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	BTNL8	Q6UX41	500 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TFAP2E	Q6VUC0	442 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	STH	Q8IWL8	128 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LAX1	Q8IWV1	398 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	UBE2J2	Q8N2K1	259 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ARFGAP2	Q8N6H7	521 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	SNX31	Q8N9S9	440 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	CSNK2A3	Q8NEV1	391 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OR8J1	Q8NGP2	316 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF418	Q8TF45	676 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF473	Q8WTR7	871 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	MRPL24	Q96A35	216 aa	Known RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	OMA1	Q96E52	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ADGRG7	Q96K78	797 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF582	Q96NG8	517 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	WAC	Q9BTA9	647 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	LRRC1	Q9BTT6	524 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FRMD8P1	Q9BZ68	369 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	METTL17	Q9H7H0	456 aa	Predicted RBP	4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FN3KRP	Q9HA64	309 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DNAJC4	Q9NNZ3	241 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TMEM45A	Q9NWC5	275 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	TAS2R13	Q9NYV9	303 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	NPAP1	Q9NZP6	1156 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	KLRF1	Q9NZS2	232 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	ZNF639	Q9UID6	485 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	DKKL1	Q9UK85	242 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867	FBXO5	Q9UKT4	447 aa		4.87	□□□□□ -1.63
PUM1-222	ENST00000531867		A0A0U1RQV5	110 aa		4.86	□□□□□ -1.63

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