RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516530.1

RNU6-1061P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 1061, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-1061P, Length 99 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-1061P-201ENST00000516530 DKC1O60832 514 aaKnown RBP eCLIP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PAHP00439 452 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CXCL10P02778 98 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CAPN1P07384 714 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RALAP11233 206 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CCNB1P14635 433 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TCN1P20061 433 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PAX7P23759 505 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MAP3K8P41279 467 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 EIF1P41567 113 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TMED10P49755 219 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 AP3M2P53677 418 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RBP5P82980 135 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OGDHQ02218 1023 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 KLHL38Q2WGJ6 581 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CCDC92Q53HC0 331 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SFT2D3Q587I9 215 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PLET1Q6UQ28 207 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 EXOC8Q8IYI6 725 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PIANPQ8IYJ0 282 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SYCP3Q8IZU3 236 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ZNF713Q8N859 430 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CEP112Q8N8E3 955 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 C19orf18Q8NEA5 215 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OR4K13Q8NH42 304 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 DQX1Q8TE96 717 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OR5P3Q8WZ94 311 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 NTAN1Q96AB6 310 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 DTD2Q96FN9 168 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 C12orf66Q96MD2 445 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 HSD17B10Q99714 261 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 BAG1Q99933 345 aaPredicted RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 VPS37BQ9H9H4 285 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RHBDL2Q9NX52 303 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TRIM10Q9UDY6 481 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MRPS18BQ9Y676 258 aaKnown RBP-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 KIAA1671Q9BY89 1806 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 VWA8A3KMH1 1905 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CARMIL1Q5VZK9 1371 aa-0.88□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 A4D1N5 150 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OR5H1A6NKK0 313 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PFKFB2O60825 505 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SLC22A5O76082 557 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 UTS2O95399 124 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CD1CP29017 333 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 KIAA1024LP59773 190 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SCRN3Q0VDG4 424 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 BFSP1Q12934 665 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 SOHLH1Q5JUK2 328 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GORABQ5T7V8 394 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 METTL21CQ5VZV1 264 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PGAP1Q75T13 922 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 PAGE2Q7Z2X7 111 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GALNTL5Q7Z4T8 443 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 EIF4E3Q8N5X7 224 aaKnown RBP-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 FIBINQ8TAL6 211 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 FAM3DQ96BQ1 224 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GPR82Q96P67 336 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GGTLC1Q9BX51 225 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 DPH5Q9H2P9 285 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RHOJQ9H4E5 214 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 KIR3DX1Q9H7L2 352 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 ANO10Q9NW15 660 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MMP17Q9ULZ9 603 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MSH6P52701 1360 aa-0.89□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GGTLC3B5MD39 225 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 NPIPA7E9PJI5 369 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 H3BRN7 92 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CHMP2AO43633 222 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MGRN1O60291 552 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OPN1MWP04001 364 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GPX1P07203 203 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 NPIPA8P0DM63 369 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OPN1MW2P0DN77 364 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OPN1MW3P0DN78 364 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CTRB1P17538 263 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RAB3BP20337 219 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RORAP35398 523 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 MAGEA8P43361 318 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 RFX3P48380 749 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TGM4P49221 684 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 UGT2B15P54855 530 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CDK16Q00536 496 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CDH17Q12864 832 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 BTN1A1Q13410 526 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 FAM71F2Q6NXP2 309 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 HSD17B11Q8NBQ5 300 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TMEM185AQ8NFB2 350 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GIPC3Q8TF64 312 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 YIPF5Q969M3 257 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 GALNT14Q96FL9 552 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 EEF2KMTQ96G04 330 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 OXGR1Q96P68 337 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 TESK2Q96S53 571 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 NPY6RQ99463 290 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 AGPAT5Q9NUQ2 364 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 UFSP2Q9NUQ7 469 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 THUMPD1Q9NXG2 353 aaKnown RBP-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 IGF2RP11717 2491 aa-0.9□□□□□ -2.55
RNU6-1061P-201ENST00000516530 CACNA1BQ00975 2339 aa-0.9□□□□□ -2.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 39.6 ms