RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515588.1

SERF1B-208, Transcript of small EDRK-rich factor 1B, human

TSL 2 BASIC

Gene SERF1B, Length 792 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC7A6OS	Q96CW6	309 aa	Predicted RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ASB9	Q96DX5	294 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FOXN4	Q96NZ1	517 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MRPL37	Q9BZE1	423 aa	Known RBP	13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SYT4	Q9H2B2	425 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR52D1	Q9H346	318 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MAGIX	Q9H6Y5	334 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	POLE4	Q9NR33	117 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	VNN3	Q9NY84	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	TMCC3	Q9ULS5	477 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CMAHP	Q9Y471	501 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SPEF1	Q9Y4P9	236 aa		13.56	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588		A0A096LNT2	108 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	AHCYL1	O43865	530 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	KRT36	O76013	467 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PPP1R3D	O95685	299 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	HEXA	P06865	529 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CST2	P09228	141 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM157B	P0CG42	384 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CDKN2A	P42771	156 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PPOX	P50336	477 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	RIPPLY3	P57055	190 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	GALK2	Q01415	458 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ENDOG	Q14249	297 aa	Known RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OTP	Q5XKR4	325 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PGM2L1	Q6PCE3	622 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	LRP11	Q86VZ4	500 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR9Q2	Q8NGE9	314 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SAMD8	Q96LT4	415 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	VRK1	Q99986	396 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	BTBD10	Q9BSF8	475 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	WNT5B	Q9H1J7	359 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	KCNN2	Q9H2S1	579 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	EMC7	Q9NPA0	242 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CCNB1IP1	Q9NPC3	277 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	VSX1	Q9NZR4	365 aa	Predicted RBP	13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC7A8	Q9UHI5	535 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FZR1	Q9UM11	496 aa		13.55	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	IQCM	A0A1B0GVH7	501 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	VSTM5	A8MXK1	200 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	TNFRSF11B	O00300	401 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SNAP29	O95721	258 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	APEH	P13798	732 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MSR1	P21757	451 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	IFNGR2	P38484	337 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	RPS6KA3	P51812	740 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ERVS71-1	P61550	626 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	HSF2	Q03933	536 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PLP2	Q04941	152 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	DBP	Q10586	325 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	TSPAN31	Q12999	210 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	TBC1D28	Q2M2D7	210 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF770	Q6IQ21	691 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CLEC2A	Q6UVW9	174 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF620	Q6ZNG0	422 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ADGRG5	Q8IZF4	528 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	GNPDA2	Q8TDQ7	276 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ERMAP	Q96PL5	475 aa	Predicted RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SYT3	Q9BQG1	590 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	RHNO1	Q9BSD3	238 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	TRIM15	Q9C019	465 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR51B6	Q9H340	312 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	C1orf198	Q9H425	327 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CDH20	Q9HBT6	801 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	CR1	P17927	2039 aa		13.54	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ABCA1	O95477	2261 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM171A2	A8MVW0	826 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	DCTN6	O00399	190 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	GYG2	O15488	501 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC16A7	O60669	478 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	MPZL1	O95297	269 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	PTH	P01270	115 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	GAST	P01350	101 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ADRA2A	P08913	450 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	STOM	P27105	288 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	SLC6A6	P31641	620 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	GUCA1A	P43080	201 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	EVX1	P49640	407 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	DSCR9	P59020	149 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	RPS23	P62266	143 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	TRAP1	Q12931	704 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM98B	Q52LJ0	330 aa	Known RBP	13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR2T5	Q6IEZ7	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	ADCK1	Q86TW2	530 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR1J2	Q8NGS2	313 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	OR2T29	Q8NH02	315 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	C10orf105	Q8TEF2	133 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	FAM168A	Q92567	244 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	TSSK2	Q96PF2	358 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	NUAK2	Q9H093	628 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	EGLN3	Q9H6Z9	239 aa		13.53	□□□□□ -0.24
SERF1B-208	ENST00000515588	COA3	Q9Y2R0	106 aa	Predicted RBP	13.53	□□□□□ -0.24

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