RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504294.5

SH3BP2-208, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 5

Gene SH3BP2, Length 557 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-208ENST00000504294 PIGFQ07326 219 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 NPRL3Q12980 569 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 AQP6Q13520 282 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 AMIGO2Q86SJ2 522 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 ZBTB46Q86UZ6 589 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 WDFY1Q8IWB7 410 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 FBXL14Q8N1E6 418 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC18Q8N456 261 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 NPEPL1Q8NDH3 523 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 TMEM171Q8WVE6 324 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 MBD6Q96DN6 1003 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 DHRS9Q9BPW9 319 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 RERGLQ9H628 205 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC25A19Q9HC21 320 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 C8orf4Q9NR00 106 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 EIF3KQ9UBQ5 218 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 REV1Q9UBZ9 1251 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 B9D1Q9UPM9 204 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 POLR1DQ9Y2S0 133 aa12.66□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 H7C1C5 153 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 HLA-DQA2P01906 255 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 COX5BP10606 129 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 CTLA4P16410 223 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF14P17017 642 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBG1P23258 451 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 IGFBP5P24593 272 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 APOBEC3AP31941 199 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 CDAP32320 146 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 RAD23AP54725 363 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SELENOVP59797 346 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 LCN6P62502 163 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 CDK5Q00535 292 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 GINS1Q14691 196 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 KDM4DQ6B0I6 523 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 PTCHD4Q6ZW05 846 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 ICA1LQ8NDH6 482 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SDR9C7Q8NEX9 313 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 NUP37Q8NFH4 326 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 GJC3Q8NFK1 279 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 NABP1Q96AH0 204 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 HS3ST6Q96QI5 342 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 CCL19Q99731 98 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 C9orf16Q9BUW7 83 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 PLA2G12AQ9BZM1 189 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 FN3KQ9H479 309 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 CDH20Q9HBT6 801 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBG2Q9NRH3 451 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 ATPIF1Q9UII2 106 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 OAZ3Q9UMX2 235 aa12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP12.65□□□□□ -0.38
SH3BP2-208ENST00000504294 ALPK2Q86TB3 2170 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 SHISA9B4DS77 424 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR23D1E9PI22 279 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 SNAP29O95721 258 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 PRR23D2P0DMB1 279 aaPredicted RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 FMO3P31513 532 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 RAD52P43351 418 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 GDI2P50395 445 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 FABP6P51161 128 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 DAPP51397 102 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBA1BP68363 451 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBA4AP68366 448 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 TUBA1AQ71U36 451 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 HS3ST5Q8IZT8 346 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 OR6V1Q8N148 313 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC37A3Q8NCC5 494 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC30A7Q8NEW0 376 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 PROKR2Q8NFJ6 384 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 OR8D4Q8NGM9 314 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 OR2AJ1Q8NGZ0 328 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 TRMT61AQ96FX7 289 aaKnown RBP12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 COG8Q96MW5 612 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF442Q9H7R0 627 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 GPR160Q9UJ42 338 aa12.64□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 OR6C68A6NDL8 312 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 TP53P04637 393 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 ZNF32P17041 273 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 PCSK6P29122 969 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 KRTAP10-9P60411 292 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 ECH1Q13011 328 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 DAG1Q14118 895 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 RAB39AQ14964 217 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 MOGQ16653 247 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 SLC35D3Q5M8T2 416 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 LRRC75A-AS1Q8N1F1 130 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 PQLC1Q8N2U9 271 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 KBTBD8Q8NFY9 601 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 OR4Q3Q8NH05 313 aa12.63□□□□□ -0.39
SH3BP2-208ENST00000504294 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP12.63□□□□□ -0.39
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.6 ms