RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492996.6

HERC4-211, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 4, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC4, Length 3,385 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC4-211ENST00000492996 SYT4Q9H2B2 425 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 RNF121Q9H920 327 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GRHPRQ9UBQ7 328 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 IKZF2Q9UKS7 526 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ING4Q9UNL4 249 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 KLHDC2Q9Y2U9 406 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MMACHCQ9Y4U1 282 aa6.32□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NCOR1O75376 2440 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 WDFY4Q6ZS81 3184 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 IGKV3D-11A0A0A0MRZ8 115 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 A0A0G2JK05 382 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TCRBV16S1A1N1A0A5B0 115 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ARPC3O15145 178 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TO15178 435 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HLA-DQA2P01906 255 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 C1QBP02746 253 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CFIP05156 583 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TRAPPC2P0DI81 140 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TRAPPC2BP0DI82 140 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PRKAR1AP10644 381 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GALNSP34059 522 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 THBS2P35442 1172 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SRP9P49458 86 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NANOS3P60323 173 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GABREP78334 506 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 C4orf46Q504U0 113 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 AKIRIN2Q53H80 203 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EEF1A1P5Q5VTE0 462 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FAM69BQ5VUD6 431 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MRPL14Q6P1L8 145 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SLC29A4Q7RTT9 530 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MS4A15Q8N5U1 240 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 POMGNT2Q8NAT1 580 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SLC38A9Q8NBW4 561 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR6N2Q8NGY6 317 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR14A16Q8NHC5 309 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF671Q8TAW3 534 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DUSP19Q8WTR2 217 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SMIM19Q96E16 107 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DERL3Q96Q80 235 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 OR1F2PQ96R84 312 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ABHD1Q96SE0 405 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NPAS1Q99742 590 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SOSTQ9BQB4 213 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TMEM43Q9BTV4 400 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 WWTR1Q9GZV5 400 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NIPAL2Q9H841 368 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EVA1AQ9H8M9 152 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 NOX4Q9NPH5 578 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EXPH5Q8NEV8 1989 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 A0A1B0GX78 115 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FRG2CA6NGY1 282 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TEX46H3BTG2 121 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SLC25A12O75746 678 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CD3GP09693 182 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 GP1BBP13224 206 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ABCD3P28288 659 aa6.31□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 ZSWIM7Q19AV6 140 aa6.31□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 TEX261Q6UWH6 196 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 C5orf46Q6UWT4 87 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SLC16A13Q7RTY0 426 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DPY19L4Q7Z388 723 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 EID2Q8N6I1 236 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 FAM71CQ8NEG0 241 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SLC39A7Q92504 469 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HYLS1Q96M11 299 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 DDOQ99489 341 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 WDR76Q9H967 626 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 UBQLN2Q9UHD9 624 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZNF222Q9UK12 451 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MRTO4Q9UKD2 239 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 U3KQ87 197 aa6.31□□□□□ -1.4
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HERC4-211ENST00000492996 GLCEO94923 617 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ZFPL1O95159 310 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TIAF1O95411 115 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 WDPCPO95876 746 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 HEXBP07686 556 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 TFPIP10646 304 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 APEHP13798 732 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 SSTR2P30874 369 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 PER3P56645 1201 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ACTA2P62736 377 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 ACTG2P63267 376 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 CCL7P80098 99 aa6.31□□□□□ -1.4
HERC4-211ENST00000492996 MZT2BQ6NZ67 158 aa6.31□□□□□ -1.4
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