RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000491134.5

PRDM2-209, Transcript of PR/SET domain 2, humanhuman

TSL 3

Gene PRDM2, Length 1,100 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRDM2-209ENST00000491134 B3GNT2Q9NY97 397 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 MOKQ9UQ07 419 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HSPE1-MOB4S4R3N1 261 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 PTPN13Q12923 2485 aa15.95■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 A0A096LPE4 126 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 A0A1W2PPZ6 126 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 CIB4A0PJX0 185 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 CLDN1O95832 211 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HRGP04196 525 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 THBDP07204 575 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 OR8G3PP0DMU2 310 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 PSKH1P11801 424 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 NPR2P20594 1047 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 IL32P24001 234 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HSPA13P48723 471 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 GLO1Q04760 184 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 PCK2Q16822 640 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 SLC35D3Q5M8T2 416 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 TIMM23BQ5SRD1 257 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 C1QTNF12Q5T7M4 302 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 LAIR2Q6ISS4 152 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 UGT2A3Q6UWM9 527 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 P2RY8Q86VZ1 359 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 C11orf40Q8WZ69 217 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 LRRC46Q96FV0 321 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 ZNF75AQ96N20 296 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 TEAD3Q99594 435 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 ZNF184Q99676 751 aaPredicted RBP15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 APOL4Q9BPW4 351 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 USB1Q9BQ65 265 aaKnown RBP15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 OR51V1Q9H2C8 321 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 RASSF1Q9NS23 344 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 SLC25A15Q9Y619 301 aa15.94■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 A0A1W2PPL8 197 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 MPZL2O60487 215 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 ENTPD6O75354 484 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 MSR1P21757 451 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 LSM6P62312 80 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 APOFQ13790 326 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 TAB1Q15750 504 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 OTPQ5XKR4 325 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 B3GLCTQ6Y288 498 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 MEPCEQ7L2J0 689 aaKnown RBP15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 TIGD4Q8IY51 512 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 ZNF511Q8NB15 262 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 OTULINQ96BN8 352 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 FBXO17Q96EF6 278 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 WFIKKN1Q96NZ8 548 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 SH3GL3Q99963 347 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 ZNF416Q9BWM5 594 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 ANKRD60Q9BZ19 345 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 SEC61A2Q9H9S3 476 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 NOX3Q9HBY0 568 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 EMC7Q9NPA0 242 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HAO2Q9NYQ3 351 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 DNAJC27Q9NZQ0 273 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 RAB26Q9ULW5 256 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 COMMD3-BMI1R4GMX3 469 aa15.93■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 DCHS2Q6V1P9 2916 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 CST2P09228 141 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 PPP3CBP16298 524 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 CENPAP49450 140 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 BLVRAP53004 296 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 TEKQ02763 1124 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 GGTLC2Q14390 218 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 SGCAQ16586 387 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 MEP1BQ16820 701 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 TEX30Q5JUR7 227 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 MEDAGQ5VYS4 303 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 GID4Q8IVV7 300 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 CCDC36Q8IYA8 594 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 SETD9Q8NE22 299 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 OBP2BQ9NPH6 170 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 LHFPL6Q9Y693 200 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 ABCA4P78363 2273 aa15.92■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HEATR1Q9H583 2144 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 TVP23AA6NH52 213 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HLA-HP01893 362 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 MYF6P23409 242 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 GSTT1P30711 240 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HTR1FP30939 366 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 FMO3P31513 532 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HIST1H3AP68431 136 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 SNTB1Q13884 538 aaKnown RBP15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 KLHL12Q53G59 568 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HIST2H3AQ71DI3 136 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 C8orf59Q8N0T1 100 aaPredicted RBP15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 OR6K6Q8NGW6 343 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 HSD17B8Q92506 261 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 PSMG3-AS1Q96PY0 264 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 WDR76Q9H967 626 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 AMDHD2Q9Y303 409 aa15.91■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa15.9■□□□□ 0.14
PRDM2-209ENST00000491134 A0A1W2PR80 420 aa15.9■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.6 ms