RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000485450.5

USP4-211, Transcript of ubiquitin specific peptidase 4, humanhuman

TSL 2

Gene USP4, Length 3,541 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP4-211ENST00000485450 PRO1933Q9H354 126 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CCDC86Q9H6F5 360 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GOLT1BQ9Y3E0 138 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ITPR1Q14643 2758 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TRAPPC13A5PLN9 417 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ALG1L2C9J202 215 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 E7EQ34 232 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LRRN3E7EW58 273 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CREBL2O60519 120 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CA11O75493 328 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IL18BPO95998 194 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IL5P05113 134 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 UMODP07911 640 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LINC00614P0C842 121 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ACP2P11117 423 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PSMB5P28074 263 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SOX18P35713 384 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RAD52P43351 418 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MECP2P51608 486 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SRSF11Q05519 484 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 INSL4Q14641 139 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF239Q16600 458 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF613Q6PF04 617 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TMPRSS11FQ6ZWK6 438 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GPR137CQ8N3F9 429 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF561Q8N587 486 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GEMIN6Q8WXD5 167 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CCNL2Q96S94 520 aaPredicted RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TLNRD1Q9H1K6 362 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TAS2R5Q9NYW4 299 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 KCND3Q9UK17 655 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PLAGL1Q9UM63 463 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 MOKQ9UQ07 419 aa6.94□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FXYD6-FXYD2A0A087WZ82 144 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CD8B2A6NJW9 211 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CYR61O00622 381 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CTDSPLO15194 276 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 IGHEP01854 428 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OPN1SWP03999 348 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CD8BP10966 210 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ZNF25P17030 456 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PPIBP23284 216 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 BSGP35613 385 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 STXBP1P61764 594 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 EFNB1P98172 346 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RGNQ15493 299 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ARHGAP40Q5TG30 622 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FAM111BQ6SJ93 734 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C15orf54Q8N8G6 183 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 THAP4Q8WY91 577 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 UBE2E3Q969T4 207 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 HIST1H2BAQ96A08 127 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FXYD6Q9H0Q3 95 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 XKR8Q9H6D3 395 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DMRT3Q9NQL9 472 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FGF21Q9NSA1 209 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FAM120CQ9NX05 1096 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ENPP4Q9Y6X5 453 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C1orf226A1L170 272 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 A8MWP6 167 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CRTAPO75718 401 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LRATO95237 230 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SOX14O95416 240 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CLPSP04118 112 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CTSBP07858 339 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ADH6P28332 368 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 DLX5P56178 289 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GMFBP60983 142 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RAB2AP61019 212 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 BLOC1S1P78537 153 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FBXW9Q5XUX1 488 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ETFRF1Q6IPR1 90 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 C6orf15Q6UXA7 325 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LHFPL4Q7Z7J7 247 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 THEM6Q8WUY1 208 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FUZQ9BT04 418 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 OR10A4Q9H209 315 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 GPN1Q9HCN4 374 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ARL15Q9NXU5 204 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CES1P1Q9UKY3 287 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RASD1Q9Y272 281 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 FAM221AA4D161 298 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 NAP1L6A6NFF2 107 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 H0YGG7 62 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PRPS1L1P21108 318 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 HCCSP53701 268 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 ARF3P61204 181 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RAP1AP62834 184 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PPIAP62937 165 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 CXADRP78310 365 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 RAE1P78406 368 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 PDE7AQ13946 482 aa6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 SFRP4Q6FHJ7 346 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
USP4-211ENST00000485450 LCN10Q6JVE6 187 aa6.93□□□□□ -1.3
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 41.6 ms