RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000474160.1

SYF2-203, Transcript of SYF2 pre-mRNA splicing factor, humanhuman

TSL 2

Gene SYF2, Length 438 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYF2-203ENST00000474160 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP16.39■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 BDH2Q9BUT1 245 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CACNG6Q9BXT2 260 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 BAIAP2Q9UQB8 552 aa16.39■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 C12orf71A8MTZ7 269 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 PCSK6P29122 969 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 LSM6P62312 80 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 HSF2Q03933 536 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 ADIPOQQ15848 244 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CD300LDQ6UXZ3 194 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 JAZF1Q86VZ6 243 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 ZNF584Q8IVC4 421 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 LRRC18Q8N456 261 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 OR9Q2Q8NGE9 314 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 FGFBP3Q8TAT2 258 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 MS4A3Q96HJ5 214 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 IFT27Q9BW83 186 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 POLE4Q9NR33 117 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CMAHPQ9Y471 501 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa16.38■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 SOCS2O14508 198 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 GNGT2O14610 69 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 RENP00797 406 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 GASTP01350 101 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 OR4A8P0C604 315 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 LAP3P28838 519 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 NOS3P29474 1203 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CDAP32320 146 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 APLNRP35414 380 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CDKN1AP38936 164 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 RAB35Q15286 201 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 GLB1L2Q8IW92 636 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 AQP11Q8NBQ7 271 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 SAMD8Q96LT4 415 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 SYT4Q9H2B2 425 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 PLK3Q9H4B4 646 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CDH20Q9HBT6 801 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 DLL4Q9NR61 685 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 IL20RAQ9UHF4 553 aa16.37■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 MED13LQ71F56 2210 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 A0A1W2PPL8 197 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 H7C1C5 153 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 SLC16A7O60669 478 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 PPP1R3DO95685 299 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 PATE4P0C8F1 98 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 COX5BP10606 129 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CTLA4P16410 223 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 ZNF32P17041 273 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 THBS4P35443 961 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 RAD52P43351 418 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 PPOXP50336 477 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 DSCR9P59020 149 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 LCN6P62502 163 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 SCRN3Q0VDG4 424 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 KCNMB1Q16558 191 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 MST1LQ2TV78 715 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 PABPC1L2AQ5JQF8 200 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 OR10G2Q8NGC3 310 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 GIPC3Q8TF64 312 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 FBXO17Q96EF6 278 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 BCL2L14Q9BZR8 327 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 RACGAP1Q9H0H5 632 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 DNAJB9Q9UBS3 223 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 U3KQV3 271 aa16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP16.36■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 FAM171A2A8MVW0 826 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 FKBP6O75344 327 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CSF3P09919 207 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CDKN2AP42771 156 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 ARHGDIAP52565 204 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 KRT80Q6KB66 452 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 PTCHD4Q6ZW05 846 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 NRBF2Q96F24 287 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 Q96MF0 132 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 OR2H1Q9GZK4 316 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 NUAK2Q9H093 628 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 VNN3Q9NY84 501 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 ATPIF1Q9UII2 106 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 FKBP7Q9Y680 259 aa16.35■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 BHLHE40O14503 412 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 ICMTO60725 284 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 IGHV4-39P01824 125 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 HIST1H1CP16403 213 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 STOMP27105 288 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 EFNA4P52798 201 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 CBX1P83916 185 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 PSG4Q00888 419 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 GLO1Q04760 184 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 AQP6Q13520 282 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 LEG1Q6P5S2 330 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 VHLLQ6RSH7 139 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 ZBTB46Q86UZ6 589 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 LNX2Q8N448 690 aa16.34■□□□□ 0.21
SYF2-203ENST00000474160 OR2T33Q8NG76 320 aa16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 27.4 ms