RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000466048.6

USP54-210, Transcript of ubiquitin specific peptidase 54, humanhuman

TSL 5

Gene USP54, Length 4,674 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP54-210ENST00000466048 PAQR8Q8TEZ7 354 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ANKRD9Q96BM1 317 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 LRFN5Q96NI6 719 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OCSTAMPQ9BR26 566 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TRAPPC4Q9Y296 219 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 NPFFR2Q9Y5X5 522 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FANCMQ8IYD8 2048 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FFAR1O14842 300 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 AQP2P41181 271 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RAB13P51153 203 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TAS2R19P59542 299 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SLC35A1P78382 337 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 DUSP2Q05923 314 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CCNJQ5T5M9 372 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RNLSQ5VYX0 342 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TMEM211Q6ICI0 200 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 H3F3CQ6NXT2 135 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR10Z1Q8NGY1 313 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TMEM41AQ96HV5 264 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CDCA4Q9BXL8 241 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 NELFAQ9H3P2 528 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF160Q9HCG1 818 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZNF226Q9NYT6 803 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PMS2P1A4D2B8 440 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RGS11O94810 467 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RPP14O95059 124 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CSTBP04080 98 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MZT1Q08AG7 82 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FUT5Q11128 374 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FZD5Q13467 585 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 Q3ZCU0 254 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TRMT12Q53H54 448 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FIP1L1Q6UN15 594 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 MRPL41Q8IXM3 137 aaKnown RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PLPP5Q8NEB5 264 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SEMA6DQ8NFY4 1073 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 LHFPL5Q8TAF8 219 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SGK3Q96BR1 496 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ZBTB8AQ96BR9 441 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 P4HTMQ9NXG6 502 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 HIF3AQ9Y2N7 669 aa6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 NUP214P35658 2090 aaPredicted RBP6.98□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 IGHV5-10-1A0A0J9YXX1 117 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PRAMEF27A3QJZ7 478 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 AIPO00170 330 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 GATCO43716 136 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FGF5P12034 268 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PCMT1P22061 227 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 RPS4Y1P22090 263 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CALCRP30988 508 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TAS2R20P59543 309 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CHRFAM7AQ494W8 412 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 KCNIP4Q6PIL6 250 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SMIM15Q7Z3B0 74 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 ADGRG3Q86Y34 549 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FAM26EQ8N5C1 309 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 M1APQ8TC57 530 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SLC2A12Q8TD20 617 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CTHRC1Q96CG8 243 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 DPH1Q9BZG8 443 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CAMK2AQ9UQM7 478 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 NCOR1O75376 2440 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 CENPFP49454 3210 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 EP300Q09472 2414 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 DFFBO76075 338 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 VAMP5O95183 116 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 DPP4P27487 766 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 C21orf33P30042 268 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 GIPRP48546 466 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 POLR2HP52434 150 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SPOCK1Q08629 439 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SLC10A1Q14973 349 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 BATFQ16520 125 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 BCL2A1Q16548 175 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 EXOSC6Q5RKV6 272 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 GDF7Q7Z4P5 450 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 LAX1Q8IWV1 398 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR4D10Q8NGI6 311 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR1L3Q8NH93 324 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FAM60AQ9NP50 221 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SPTA1P02549 2419 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SPAG17Q6Q759 2223 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 IGHV5-51A0A0C4DH38 117 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 TRDV1A0A1B0GX56 115 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SERINC4A6NH21 518 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR2F2O95006 317 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SOX3P41225 446 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR2F1Q13607 317 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 OR10K2Q6IF99 312 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 BEND4Q6ZU67 534 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 PRR22Q8IZ63 422 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 APH1BQ8WW43 257 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 FYTTD1Q96QD9 318 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 SLC6A7Q99884 636 aa6.97□□□□□ -1.29
USP54-210ENST00000466048 REV1Q9UBZ9 1251 aa6.97□□□□□ -1.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 116.4 ms