RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463041.1

PTPRF-210, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type F, human

TSL 3

Gene PTPRF, Length 298 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
PTPRF-210	ENST00000463041	NKPD1	Q17RQ9	610 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	PCGF3	Q3KNV8	242 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF718	Q3SXZ3	478 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ZBED5	Q49AG3	693 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	PABPC1L2A	Q5JQF8	200 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	FAM120AOS	Q5T036	256 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	GLYAT	Q6IB77	296 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TMEM154	Q6P9G4	183 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TREML1	Q86YW5	311 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	NRM	Q8IXM6	262 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	PAQR4	Q8N4S7	273 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	LINC01356	Q8N9X3	169 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	CPEB3	Q8NE35	698 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	NSMAF	Q92636	917 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	FAM162A	Q96A26	154 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	NABP1	Q96AH0	204 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	POM121L2	Q96KW2	1035 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	KCTD14	Q9BQ13	255 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF416	Q9BWM5	594 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	NDEL1	Q9GZM8	345 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	MYLK2	Q9H1R3	596 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	NMNAT1	Q9HAN9	279 aa	Predicted RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	HINT3	Q9NQE9	182 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	MYEF2	Q9P2K5	600 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	GMPR2	Q9P2T1	348 aa	Known RBP	6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	RHCG	Q9UBD6	479 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ABCD2	Q9UBJ2	740 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	FZR1	Q9UM11	496 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TMEM5	Q9Y2B1	443 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TIMM10B	Q9Y5J6	103 aa		6.24	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ARHGAP32	A7KAX9	2087 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	DYSF	O75923	2080 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TRAV27	A0A087WT01	109 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	IGKV1D-43	A0A0B4J1Z2	117 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041		A0A1W2PRQ8	180 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	RNF212B	A8MTL3	300 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	C12orf71	A8MTZ7	269 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041		B4DSR2	109 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	XKRY	O14609	159 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	PIP5K1C	O60331	668 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	H1F0	P07305	194 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	NAT2	P11245	290 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ZNF16	P17020	682 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	SRD5A1	P18405	259 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	DRD4	P21917	467 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	PCMT1	P22061	227 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	FUT4	P22083	530 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	CCNO	P22674	350 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TUBG1	P23258	451 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	IGFBP5	P24593	272 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	LAP3	P28838	519 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	GCH1	P30793	250 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	RPL4	P36578	427 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	LIPA	P38571	399 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	CRYBB2	P43320	205 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	NUDT2	P50583	147 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	CDH15	P55291	814 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	SMIM11A	P58511	58 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ERVK-25	P63136	954 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	PSG4	Q00888	419 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	FMOD	Q06828	376 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TOP3A	Q13472	1001 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	DGCR6	Q14129	220 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	MAD2L1BP	Q15013	274 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	FAM209A	Q5JX71	171 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	GPR139	Q6DWJ6	353 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TBPL2	Q6SJ96	375 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ARL9	Q6T311	187 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	FOXL2NB	Q6ZUU3	175 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TSEN54	Q7Z6J9	526 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	CPLX4	Q7Z7G2	160 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	OR1J1	Q8NGS3	322 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	AKR7L	Q8NHP1	331 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	SLC7A13	Q8TCU3	470 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	SNX33	Q8WV41	574 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	HSH2D	Q96JZ2	352 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	SNX18	Q96RF0	628 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	OR2H1	Q9GZK4	316 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	RACGAP1	Q9H0H5	632 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	GORASP2	Q9H8Y8	452 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ELOVL3	Q9HB03	270 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	SPAG4	Q9NPE6	437 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TUBG2	Q9NRH3	451 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	DCAF13	Q9NV06	445 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ADA2	Q9NZK5	511 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	GRHPR	Q9UBQ7	328 aa		6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TMEFF2	Q9UIK5	374 aa	Predicted RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	SAMD4A	Q9UPU9	718 aa	Known RBP	6.23	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	LOC100509620	A0A075B734	347 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	C5orf49	A4QMS7	147 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041		H3BSA7	217 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	CDC42EP2	O14613	210 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	PPIH	O43447	177 aa	Known RBP	6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	SNX3	O60493	162 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ICMT	O60725	284 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	NDUFB2	O95178	105 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	TF	P02787	698 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	COX5B	P10606	129 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	ANPEP	P15144	967 aa		6.22	□□□□□ -1.41
PTPRF-210	ENST00000463041	NCK1	P16333	377 aa		6.22	□□□□□ -1.41

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