RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000454947.1

SH3BP4-207, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

TSL 4

Gene SH3BP4, Length 500 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-207ENST00000454947 SRSF1Q07955 248 aaKnown RBP eCLIP8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 MED21Q13503 144 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 APOFQ13790 326 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 CDSNQ15517 529 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST2H3PS2Q5TEC6 136 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 LCN1P1Q5VSP4 162 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM27BQ5VT28 67 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 LYPD4Q6UWN0 246 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 STAC2Q6ZMT1 411 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 HIST2H3AQ71DI3 136 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 C17orf78Q8N4C9 275 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF433Q8N7K0 673 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 PROKR2Q8NFJ6 384 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 OR1K1Q8NGR3 316 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 BCL2L2Q92843 193 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 CNBD2Q96M20 576 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 FOXB1Q99853 325 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF649Q9BS31 505 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 RHNO1Q9BSD3 238 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 WACQ9BTA9 647 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 OR10A4Q9H209 315 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 DUSP21Q9H596 190 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 SIAEQ9HAT2 523 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 PAK1IP1Q9NWT1 392 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 CLN6Q9NWW5 311 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 GALNT8Q9NY28 637 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 CNOT2Q9NZN8 540 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 PSORS1C1Q9UIG5 152 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 KCNG2Q9UJ96 466 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 EXOGQ9Y2C4 368 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 CACNA1CQ13936 2221 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP4-207ENST00000454947 ARPC4-TTLL3A0A0A6YYG9 625 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 SNTNA6NMZ2 147 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 GPANK1O95872 356 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 SBK2P0C263 348 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 COX6B1P14854 86 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 B4GALT1P15291 398 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 MSR1P21757 451 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 FMO3P31513 532 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 CD79BP40259 229 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 MTNR1AP48039 350 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF84P51523 738 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 NUDT6P53370 316 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ARF1P84077 181 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 SORDQ00796 357 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 RAB40BQ12829 278 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 POU4F2Q12837 409 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 FAPQ12884 760 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 GABRA6Q16445 453 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 RNLSQ5VYX0 342 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ANKRD16Q6P6B7 361 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF511Q8NB15 262 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ACBD4Q8NC06 268 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 STEAP2Q8NFT2 490 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 OR51L1Q8NGJ5 315 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 C11orf40Q8WZ69 217 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 NSMAFQ92636 917 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 LGALS12Q96DT0 336 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ZMYND19Q96E35 227 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 CNN2Q99439 309 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
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SH3BP4-207ENST00000454947 HDHD5Q9BXW7 423 aa8.21□□□□□ -1.1
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SH3BP4-207ENST00000454947 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 FGF20Q9NP95 211 aaPredicted RBP8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 NDRG3Q9UGV2 375 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 CYB5R1Q9UHQ9 305 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 RPL36Q9Y3U8 105 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 LHFPL6Q9Y693 200 aa8.21□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.21□□□□□ -1.1
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SH3BP4-207ENST00000454947 FASNP49327 2511 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 CIB4A0PJX0 185 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 EFCAB10A6NFE3 127 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 PRR32B1ATL7 298 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 C16orf97H3BN30 126 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 XPNPEP2O43895 674 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 HTR1AP08908 422 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 CST2P09228 141 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 RNF224P0DH78 156 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 HOXB1P14653 301 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 PPP3CBP16298 524 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 CDAP32320 146 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ENTPD1P49961 510 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 GABARAPL2P60520 117 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 IRF3Q14653 427 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 KCTD21Q4G0X4 260 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 KLHL12Q53G59 568 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 RBM48Q5RL73 367 aaKnown RBP8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 SFRP5Q5T4F7 317 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 ZNF684Q5T5D7 378 aa8.2□□□□□ -1.1
SH3BP4-207ENST00000454947 KRT80Q6KB66 452 aa8.2□□□□□ -1.1
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