RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBG2Q9NRH3 451 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GPR160Q9UJ42 338 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDRG4Q9ULP0 352 aaKnown RBP7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CMAHPQ9Y471 501 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CDH10Q9Y6N8 788 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 VPS13CQ709C8 3753 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSPG4Q6UVK1 2322 aa7.43□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZANQ9Y493 2812 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFS8O00217 210 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KHDRBS3O75525 346 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC2A10O95528 541 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RENP00797 406 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD8AP01732 235 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF35P13682 527 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NOS3P29474 1203 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CALCRP30988 508 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAD52P43351 418 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CENPAP49450 140 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 EFNA4P52798 201 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERVK-25P63136 954 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBA1BP68363 451 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBA4AP68366 448 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MS4A2Q01362 244 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLO1Q04760 184 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SNTB2Q13425 540 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 AQP6Q13520 282 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MOGQ16653 247 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SWI5Q1ZZU3 235 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MICAQ29983 383 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MESTQ5EB52 335 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM209AQ5JX71 171 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CD300LDQ6UXZ3 194 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RASSF6Q6ZTQ3 369 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TUBA1AQ71U36 451 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IGFN1Q86VF2 1251 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 JAZF1Q86VZ6 243 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 GLB1L2Q8IW92 636 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WDFY1Q8IWB7 410 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC30A7Q8NEW0 376 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 WFDC11Q8NEX6 87 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4C15Q8NGM1 316 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEUROG1Q92886 237 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC7A6OSQ96CW6 309 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COX4I2Q96KJ9 171 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q96M85 177 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 COG8Q96MW5 612 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PLK3Q9H4B4 646 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 POLE4Q9NR33 117 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DLL4Q9NR61 685 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IL20Q9NYY1 176 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CGGBP1Q9UFW8 167 aaPredicted RBP7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNG2Q9UJ96 466 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADAM18Q9Y3Q7 739 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UGT2A1Q9Y4X1 527 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RTTNQ86VV8 2226 aa7.42□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NAV3Q8IVL0 2385 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TCRBV3S1A0A5B6 114 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CST1P01037 141 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OR4A8P0C604 315 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FCGR1AP12314 374 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF26P17031 533 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FUT4P22083 530 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LAP3P28838 519 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ARHGDIAP52565 204 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 BLVRAP53004 296 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NUDT6P53370 316 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FXYD6P3P58550 94 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MYBPC1Q00872 1141 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 HGFACQ04756 655 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FMODQ06828 376 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PIGFQ07326 219 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB39AQ14964 217 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADIPOQQ15848 244 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KCNMB1Q16558 191 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SGCAQ16586 387 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SLC36A3Q495N2 470 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ZNF770Q6IQ21 691 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CLEC2AQ6UVW9 174 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DNM1P46Q6ZS02 220 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LSRQ86X29 649 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADGRG5Q8IZF4 528 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NRBF2Q96F24 287 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 Q96MF0 132 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ERMAPQ96PL5 475 aaPredicted RBP7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 DCLRE1CQ96SD1 692 aaKnown RBP7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SH3GL3Q99963 347 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IFT27Q9BW83 186 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHID1Q9BWS9 393 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 RAB1BQ9H0U4 201 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MS4A5Q9H3V2 200 aa7.41□□□□□ -1.22
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SEC61A2Q9H9S3 476 aa7.41□□□□□ -1.22
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 47.1 ms