RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000409024.3

POLR1A-202, Transcript of RNA polymerase I subunit A, humanhuman

TSL 3

Gene POLR1A, Length 560 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM127O75204 238 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GATBO75879 557 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF432O94892 652 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SYNGR4O95473 234 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 F10P00742 488 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 IGHG3P01860 377 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TCEA1P23193 301 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DCTDP32321 178 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MAGEA5P43359 124 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CSNK1A1P48729 337 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CCR9P51686 369 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN17P56750 224 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN18P56856 261 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN20P56880 219 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LSM6P62312 80 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SRSF6Q13247 344 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CDK5R1Q15078 307 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RIPPLY2Q5TAB7 128 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 VASNQ6EMK4 673 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FOXL2NBQ6ZUU3 175 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PNPLA5Q7Z6Z6 429 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF679Q8IYX0 411 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GHDCQ8N2G8 530 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RPL3LQ92901 407 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SMIM19Q96E16 107 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DNAJA3Q96EY1 480 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PELI1Q96FA3 418 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR8B4Q96RC9 309 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DCUN1D5Q9BTE7 237 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 HES7Q9BYE0 225 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MROQ9BYG7 248 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SRXN1Q9BYN0 137 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MMP27Q9H306 513 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 B3GAT2Q9NPZ5 323 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 PARPBPQ9NWS1 579 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MRPL22Q9NWU5 206 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TXNL4BQ9NX01 149 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GLTPQ9NZD2 209 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 EMC3Q9P0I2 261 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ST6GALNAC2Q9UJ37 374 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MCTS1Q9ULC4 181 aaKnown RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 COPS3Q9UNS2 423 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 EML6Q6ZMW3 1958 aa8.71□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 A0A075B6Q4 140 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TRGV5A0A0B4J1U4 118 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LOC100506127A0A0U1RQW1 187 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TVP23AA6NH52 213 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF716A6NP11 495 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF724A8MTY0 619 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FAM171A2A8MVW0 826 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZNF814B7Z6K7 855 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CXCL13O43927 109 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SLC43A1O75387 559 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ABHD16AO95870 558 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LALBAP00709 142 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OPN1LWP04000 364 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 NPR2P20594 1047 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 NR4A1P22736 598 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CD79BP40259 229 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RORCP51449 518 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CLDN15P56746 228 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 LSM3P62310 102 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ADAM8P78325 824 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RASGEF1BQ0VAM2 473 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DYNC1I2Q13409 638 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CAMK2DQ13557 499 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DOC2BQ14184 412 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 RNPS1Q15287 305 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MOGQ16653 247 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 NRN1LQ496H8 165 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FCRLAQ7L513 359 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CHMP1BQ7LBR1 199 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SSX6Q7RTT6 188 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 DPY19L4Q7Z388 723 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TPRA1Q86W33 373 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CROCCP3Q8IVE0 287 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 C20orf196Q8IYI0 205 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TMEM123Q8N131 208 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 ZIC4Q8N9L1 334 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SYT14Q8NB59 555 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR10H5Q8NGA6 315 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 NDNFQ8TB73 568 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 THEM6Q8WUY1 208 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 S100ZQ8WXG8 99 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 MCHR2Q969V1 340 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 OR2M2Q96R28 347 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CENPOQ9BU64 300 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 EMC6Q9BV81 110 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 CDADC1Q9BWV3 514 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 SLIRPQ9GZT3 109 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 NXF2Q9GZY0 626 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 NIPAL2Q9H841 368 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 EXOSC4Q9NPD3 245 aaKnown RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 GNG8Q9UK08 70 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 FLVCR1Q9Y5Y0 555 aa8.7□□□□□ -1.02
POLR1A-202ENST00000409024 TRBV2A0A0J9YWF9 115 aa8.69□□□□□ -1.02
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