RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000398621.3

PGGT1BP2-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 2, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP2, Length 1,028 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NPEPL1Q8NDH3 523 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SDR9C7Q8NEX9 313 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2T4Q8NH00 348 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LILRB1Q8NHL6 650 aaPredicted RBP13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GRIP2Q9C0E4 1043 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RNF121Q9H920 327 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCNB1IP1Q9NPC3 277 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CMC2Q9NRP2 79 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 B9D1Q9UPM9 204 aa13.29□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CELSR2Q9HCU4 2923 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGLV1-36A0A0B4J1U3 117 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATE1O95260 518 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF3P17036 446 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A1P53007 311 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PIGFQ07326 219 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ETFDHQ16134 617 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF362Q5T0B9 420 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6V1Q8N148 313 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LRRC18Q8N456 261 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NUP37Q8NFH4 326 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR1J2Q8NGS2 313 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR4Q3Q8NH05 313 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DDOQ99489 341 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DHRS9Q9BPW9 319 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NOX3Q9HBY0 568 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RPRD1BQ9NQG5 326 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CISD1Q9NZ45 108 aaKnown RBP13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 MOKQ9UQ07 419 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COA3Q9Y2R0 106 aaPredicted RBP13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPEF1Q9Y4P9 236 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TIMM10BQ9Y5J6 103 aa13.28□□□□□ -0.28
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGHV2OR16-5A0A0B4J2B6 119 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR6C68A6NDL8 312 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 VSTM5A8MXK1 200 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP6V1G2-DDX39BF2Z307 99 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGFBP1P08833 259 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CD53P19397 219 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 POU1F1P28069 291 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CENPAP49450 140 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DAPP51397 102 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BLVRAP53004 296 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CDK5Q00535 292 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HSF2Q03933 536 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SPOCK1Q08629 439 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SCRN3Q0VDG4 424 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AQP6Q13520 282 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ENDOGQ14249 297 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KDM4DQ6B0I6 523 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC37A3Q8NCC5 494 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FGFBP3Q8TAT2 258 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SMAP2Q8WU79 429 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 STMN2Q93045 179 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 FBXO17Q96EF6 278 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PKP2Q99959 881 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM4BQ9BQ04 359 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RBM4Q9BWF3 364 aaKnown RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PRRG3Q9BZD7 231 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RERGLQ9H628 205 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC25A19Q9HC21 320 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 S100A14Q9HCY8 104 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KRT84Q9NSB2 600 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 BEX4Q9NWD9 120 aaPredicted RBP13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 KCNG2Q9UJ96 466 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OAZ3Q9UMX2 235 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ATP23Q9Y6H3 246 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa13.27□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 E7EQL1 145 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SNAP29O95721 258 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CELA3BP08861 270 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PATE4P0C8F1 98 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GAAP10253 952 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 COX5BP10606 129 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF35P13682 527 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF32P17041 273 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 PAICSP22234 425 aaKnown RBP13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRISP1P54107 249 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CRMP1Q14194 572 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 GINS1Q14691 196 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 RAB39AQ14964 217 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TBC1D28Q2M2D7 210 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 AGAP6Q5VW22 663 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 DTX2Q86UW9 622 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF584Q8IVC4 421 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC30A7Q8NEW0 376 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SLC26A10Q8NG04 563 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 IGFBPL1Q8WX77 278 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NRGNQ92686 78 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 HTRA1Q92743 480 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 TSSK2Q96PF2 358 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CCL19Q99731 98 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF416Q9BWM5 594 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 NMNAT2Q9BZQ4 307 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 OR2H1Q9GZK4 316 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 SEMA6AQ9H2E6 1030 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 LIME1Q9H400 295 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 CXorf56Q9H5V9 222 aa13.26□□□□□ -0.29
PGGT1BP2-201ENST00000398621 ZNF442Q9H7R0 627 aa13.26□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.9 ms