RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000365367.1

RNU6-53P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 53, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-53P, Length 106 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-53P-201ENST00000365367 A0A1W2PQD3 144 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SYCE3A1L190 88 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HTR3EA5X5Y0 456 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAGEA13PA6NCF6 341 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ANKRD61A6NGH8 418 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 LIPT2A6NK58 231 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 IFITM10A6NMD0 228 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 LRRN3E7EW58 273 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MS4A18H0YCH9 400 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 H0YIV9 168 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 H3BNX3 289 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 H3BUI4 141 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 RPL36A-HNRNPH2H7BZ11 118 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KIF2AO00139 706 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 P2RY10O00398 339 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MANBAO00462 879 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRYO14603 147 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 NPFFO15130 113 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SPOPO43791 374 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 DOK2O60496 412 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 NPIPB7O75200 414 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 UGT2B17O75795 530 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CDK2AP2O75956 126 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MFN2O95140 757 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PMS2P2O95744 297 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PDYNP01213 254 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 IFNB1P01574 187 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CD55P08174 381 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MMP7P09237 267 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HIST1H2AGP0C0S8 130 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PABPC4LP0CB38 370 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRB4P10163 310 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PF4V1P10720 104 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRG2P13727 222 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 DESP17661 470 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HIST1H2ADP20671 130 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CD24P25063 80 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 FASP25445 335 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 GSTM2P28161 218 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 EPHA3P29320 983 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 TACR3P29371 465 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ARR3P36575 388 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PIK3CBP42338 1070 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAGEA6P43360 314 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 TNNT3P45378 269 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PTDSS1P48651 473 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PITPNBP48739 271 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 NPY2RP49146 381 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 FNTAP49354 379 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CEBPDP49716 269 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 VPS41P49754 854 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF84P51523 738 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 P2RX1P51575 399 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CCR4P51679 360 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ZNF41P51814 821 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 RAP1GDS1P52306 607 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 RAD23AP54725 363 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HADHBP55084 474 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 XGP55808 180 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 UCP2P55851 309 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 P2RX3P56373 397 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CLDN17P56750 224 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR2B6P58173 313 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 RPL23AP62750 156 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HAMPP81172 84 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 IRF8Q02556 426 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 EMX1Q04741 257 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 C2orf54Q08AI8 447 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PSG7Q13046 419 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 BIKQ13323 160 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MAB21L1Q13394 359 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CUL3Q13618 768 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PMS2P11Q13670 270 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CEACAM7Q14002 265 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KIAA0141Q14154 515 aaPredicted RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CRYMQ14894 314 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KPNB1Q14974 876 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MFSD13AQ14CX5 517 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 FASTKD3Q14CZ7 662 aaKnown RBP0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 OR7A5Q15622 319 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MPPED2Q15777 294 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PDK4Q16654 411 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 GSG1Q2KHT4 349 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 TBC1D28Q2M2D7 210 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 HFEQ30201 348 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MS4A18Q3C1V0 323 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ARHGAP11BQ3KRB8 267 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 KRTAP27-1Q3LI81 207 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 ESCO2Q56NI9 601 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SGO1Q5FBB7 561 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PDSS1Q5T2R2 415 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PDZK1Q5T2W1 519 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 PRAMEF6Q5VXH4 476 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM90A2PQ658T7 463 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 LGALS9CQ6DKI2 356 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 FAM45BPQ6NSW5 357 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 MRNIPQ6NTE8 343 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 CDC73Q6P1J9 531 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 SLC27A4Q6P1M0 643 aa0.96□□□□□ -2.26
RNU6-53P-201ENST00000365367 NIPAL3Q6P499 406 aa0.96□□□□□ -2.26
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 35.6 ms