RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361543.3

SGMS1-201, Transcript of sphingomyelin synthase 1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene SGMS1, Length 1,096 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SGMS1-201ENST00000361543 PDLIM4P50479 330 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 HMGA2P52926 109 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RAP1BP61224 184 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RPS23P62266 143 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RAP1AP62834 184 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MS4A2Q01362 244 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FMODQ06828 376 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 LOXL1Q08397 574 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CD47Q08722 323 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TOP3AQ13472 1001 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RAB39AQ14964 217 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CARTPTQ16568 116 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC36A2Q495M3 483 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NRN1LQ496H8 165 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 C10orf128Q5T292 105 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ARMC4Q5T2S8 1044 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T5Q6IEZ7 315 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM53Q6P2H8 277 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PODNL1Q6PEZ8 512 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 LIAT1Q6ZQX7 453 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ASRGL1Q7L266 308 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC16A14Q7RTX9 510 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DPPA2Q7Z7J5 298 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MEX3DQ86XN8 651 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF584Q8IVC4 421 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FAM86B1Q8N7N1 296 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR2T29Q8NH02 315 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 FGFBP3Q8TAT2 258 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJC9Q8WXX5 260 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TNFRSF13CQ96RJ3 184 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PIMREGQ9BSJ6 248 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CHID1Q9BWS9 393 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RAB1BQ9H0U4 201 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TXNIPQ9H3M7 391 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SMURF2Q9HAU4 748 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DYNLRB1Q9NP97 96 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MYOZ1Q9NP98 299 aaPredicted RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SAMHD1Q9Y3Z3 626 aaKnown RBP6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CMAHPQ9Y471 501 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SPEF1Q9Y4P9 236 aa6.61□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MALRD1Q5VYJ5 2156 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 LOC390937A0A1W2PQ73 354 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM129A0AVI4 362 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 A6NJY4 79 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFS8O00217 210 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 XKRYO14609 159 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TLX2O43763 284 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 E2F6O75461 281 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CCNB2O95067 398 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NDUFB2O95178 105 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 CST1P01037 141 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SERPINA5P05154 406 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 USF1P22415 310 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GLRXP35754 106 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RPL4P36578 427 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GUCA1AP43080 201 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GPR4P46093 362 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF133P52736 654 aaPredicted RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RPL27P61353 136 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MRPS34P82930 218 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 COX10Q12887 443 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 LAPTM4AQ15012 233 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TMEM249Q2WGJ8 235 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZBED5Q49AG3 693 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 C6orf52Q5T4I8 152 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 GPR139Q6DWJ6 353 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZFP1Q6P2D0 407 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IGFN1Q86VF2 1251 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ADGRG5Q8IZF4 528 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZCCHC24Q8N2G6 241 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 LRRC18Q8N456 261 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 PAPD5Q8NDF8 572 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 SLC30A7Q8NEW0 376 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR52L1Q8NGH7 329 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR13C2Q8NGS9 318 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OR52J3Q8NH60 311 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 HDAC2Q92769 488 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL24Q96A35 216 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NMD3Q96D46 503 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 NRBF2Q96F24 287 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TSPAN32Q96QS1 320 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DOK1Q99704 481 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ALG12Q9BV10 488 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 OSBPL10Q9BXB5 764 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TEX12Q9BXU0 123 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 MRPL37Q9BZE1 423 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 C1orf198Q9H425 327 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 RNF121Q9H920 327 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ZNF556Q9HAH1 456 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 DNAJB9Q9UBS3 223 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 ENOPH1Q9UHY7 261 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 LYVE1Q9Y5Y7 322 aa6.6□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TANC2Q9HCD6 1990 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 TRBV4-1A0A0J9YWV2 114 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 IQCMA0A1B0GVH7 501 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 UNC119BA6NIH7 251 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 A8MV72 311 aaPredicted RBP6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 VWC2LB2RUY7 222 aa6.59□□□□□ -1.35
SGMS1-201ENST00000361543 M0R233 179 aa6.59□□□□□ -1.35
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