RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000335475.5

KCNQ1-202, Transcript of potassium voltage-gated channel subfamily Q member 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene KCNQ1, Length 2,159 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNQ1-202ENST00000335475 ITGA5P08648 1049 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 IFNGR1P15260 489 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 MAP2K6P52564 334 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 EMP2P54851 167 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 RAP1BP61224 184 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 RAP1AP62834 184 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 GALK2Q01415 458 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 PCK2Q16822 640 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 C6orf183Q5T699 404 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 SEZ6L2Q6UXD5 910 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 H1FNTQ75WM6 255 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 PIAS4Q8N2W9 510 aaPredicted RBP18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 EMC3Q9P0I2 261 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF222Q9UK12 451 aa18.61■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 TRIOBPQ9H2D6 2365 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 IGKV1D-43A0A0B4J1Z2 117 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF208O43345 1280 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 RAD1O60671 282 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 HPXP02790 462 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 NAGAP17050 411 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 PSMB1P20618 241 aaKnown RBP18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 DCTDP32321 178 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 DHPSP49366 369 aaPredicted RBP18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 EFNB2P52799 333 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 MFSD13AQ14CX5 517 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 LCN10Q6JVE6 187 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 NDUFAF7Q7L592 441 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 TTC9Q92623 222 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CCDC74BQ96LY2 380 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CHST11Q9NPF2 352 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 FSCN3Q9NQT6 498 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 STMN3Q9NZ72 180 aa18.6■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 MEIKINA0A087WXM9 373 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 XRCC3O43542 346 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ZP1P60852 638 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD16Q6P6B7 361 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 OR51D1Q8NGF3 324 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 C15orf40Q8WUR7 153 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ASB5Q8WWX0 329 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 NKIRAS2Q9NYR9 191 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 SIT1Q9Y3P8 196 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 RALGAPA1Q6GYQ0 2036 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ANKRD34BA5PLL1 514 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 SHISA8B8ZZ34 492 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 NPIPA5E9PKD4 350 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC17A2O00624 439 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 EFNA2O43921 213 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 DAP3P51398 398 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM205Q6UW68 189 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 MAMSTRQ6ZN01 415 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CPEB2Q7Z5Q1 589 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ZNF248Q8NDW4 579 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 OR11H4Q8NGC9 324 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 ST7LQ8TDW4 575 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 KCNK15Q9H427 330 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 BEX1Q9HBH7 125 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 FANCFQ9NPI8 374 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 FBXL3Q9UKT7 428 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 NPIPA1Q9UND3 350 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 GTF2A1LQ9UNN4 478 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 B3GALT1Q9Y5Z6 326 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 NPTNQ9Y639 398 aa18.59■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 IGLV3-32A0A0A0MS00 114 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CTAG2O75638 210 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 FSTP19883 344 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 POU3F4P49335 361 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 VEGFCP49767 419 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 SLC25A53Q5H9E4 307 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 TMEM225Q6GV28 225 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 FAAP20Q6NZ36 180 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 CREB3L2Q70SY1 520 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 APMAPQ9HDC9 416 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 R4GMQ9 66 aa18.58■□□□□ 0.57
KCNQ1-202ENST00000335475 A0A1B0GUH1 482 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 CIB4A0PJX0 185 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 LIPT2A6NK58 231 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 TGM6O95932 706 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 IGFBP3P17936 291 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 HSF1Q00613 529 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 POU3F1Q03052 451 aaPredicted RBP18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 PLPPR5Q32ZL2 321 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 LINC00303Q3SY05 128 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 POC1BQ8TC44 478 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 DDIT4LQ96D03 193 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 UTP23Q9BRU9 249 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 MED29Q9NX70 200 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ALKBH4Q9NXW9 302 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 PTTG3PQ9NZH4 202 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 KLHL13Q9P2N7 655 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ING4Q9UNL4 249 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 DHDHQ9UQ10 334 aa18.58■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 GGT3PA6NGU5 568 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 PRAF2O60831 178 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 ALDOBP05062 364 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 CD37P11049 281 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 TLE3Q04726 772 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 PMS2CLQ68D20 193 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 DNM1P34Q6PK57 102 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 NHLRC1Q6VVB1 395 aa18.57■□□□□ 0.56
KCNQ1-202ENST00000335475 POTEKPQ9BYX7 375 aa18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 36.5 ms