RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261443.9

CSDE1-201, Transcript of cold shock domain containing E1, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene CSDE1, Length 3,228 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSDE1-201ENST00000261443 RAB7BQ96AH8 199 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 MALSU1Q96EH3 234 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ADAD1Q96M93 576 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 MESP1Q9BRJ9 268 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 RNF126Q9BV68 326 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 SLC17A9Q9BYT1 436 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ULBP3Q9BZM4 244 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ZMAT3Q9HA38 289 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 RXFP3Q9NSD7 469 aa6.55□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 SLC23A2Q9UGH3 650 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 KCNG2Q9UJ96 466 aa6.55□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 PEX12O00623 359 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 GRM6O15303 877 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 DUSP11O75319 330 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 CDX1P47902 265 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 CHAF1BQ13112 559 aa6.55□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 OR4S1Q8NGB4 309 aa6.55□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 OR51A4Q8NGJ6 313 aa6.55□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 CHST5Q9GZS9 411 aa6.55□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 KIAA1549LQ6ZVL6 1849 aa6.54□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 OR5B2Q96R09 309 aa6.54□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 NRSN2Q9GZP1 204 aa6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 PCBD2Q9H0N5 130 aa6.54□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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CSDE1-201ENST00000261443 ZNF432O94892 652 aa6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 AK1P00568 194 aa6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ERCC1P07992 297 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 NGFRP08138 427 aa6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 DDTP30046 118 aa6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ID4P47928 161 aa6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 SLC6A9P48067 706 aa6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 CYCSP99999 105 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 TCTN1Q2MV58 587 aa6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 ELOA3BQ3SY89 546 aa6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 RNASE10Q5GAN6 216 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 PAPD4Q6PIY7 484 aaKnown RBP6.54□□□□□ -1.36
CSDE1-201ENST00000261443 PPP1R3BQ86XI6 285 aa6.54□□□□□ -1.36
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