RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000637694.1

CNTNAP2-222, Transcript of contactin associated protein like 2, human

TSL 5

Gene CNTNAP2, Length 2,213 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

Download Table

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RPAP2	Q8IXW5	612 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MSL3	Q8N5Y2	521 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC150	Q8NCX0	1101 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PGBD1	Q96JS3	809 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	STAG3	Q9UJ98	1225 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PHACTR2	O75167	634 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ECM2	O94769	699 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SFPQ	P23246	707 aa	Known RBP eCLIP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TXLNA	P40222	546 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TBC1D8B	Q0IIM8	1120 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NEDD9	Q14511	834 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WWC2	Q6AWC2	1192 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HDX	Q7Z353	690 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	C14orf37	Q86TY3	774 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HNRNPLL	Q8WVV9	542 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BSDC1	Q9NW68	430 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TFIP11	Q9UBB9	837 aa	Known RBP	10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SNX14	Q9Y5W7	946 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MRFAP1	Q9Y605	127 aa		10.13	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SALL3	Q9BXA9	1300 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIF24	Q5T7B8	1368 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	STRC	Q7RTU9	1775 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA6L4	A6NEF3	574 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BECN2	A8MW95	431 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CPA1	P15085	419 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZKSCAN8	Q15776	578 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	JAKMIP3	Q5VZ66	844 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RASEF	Q8IZ41	740 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CTCFL	Q8NI51	663 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LEO1	Q8WVC0	666 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	N4BP2L2	Q92802	583 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPATA32	Q96LK8	384 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM107B	Q9H098	131 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM204A	Q9H8W3	233 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	L1RE1	Q9UN81	338 aa		10.12	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GCFC2	P16383	781 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IRX1	P78414	480 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	STX1A	Q16623	288 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TMC6	Q7Z403	805 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	UNC5CL	Q8IV45	518 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TEX11	Q8IYF3	940 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PRPF38A	Q8NAV1	312 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TATDN2	Q93075	761 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	WDR24	Q96S15	920 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	API5	Q9BZZ5	524 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	HYPK	Q9NX55	129 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	IQGAP3	Q86VI3	1631 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VWA3A	A6NCI4	1184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PSME1	Q06323	249 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DDR1	Q08345	913 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZC3H12A	Q5D1E8	599 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM71B	Q8TC56	605 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GOLGA1	Q92805	767 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZKSCAN4	Q969J2	545 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ITFG2	Q969R8	447 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RILPL2	Q969X0	211 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ANKZF1	Q9H8Y5	726 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	VEZT	Q9HBM0	779 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM169A	Q9Y6X4	670 aa		10.11	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP5	P45974	858 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	AOPEP	Q8N6M6	819 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	BICD2	Q8TD16	824 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	XPO4	Q9C0E2	1151 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SCAND2P	Q9GZW5	306 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CD248	Q9HCU0	757 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZBTB12	Q9Y330	459 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	SPHKAP	Q2M3C7	1700 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ADCY9	O60503	1353 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RTN2	O75298	545 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EIF3J	O75822	258 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ERCC3	P19447	782 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCNH	P51946	323 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	NBPF5P	Q86XG9	351 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FAM177A1	Q8N128	213 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	FBXO41	Q8TF61	875 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PNKP	Q96T60	521 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MPHOSPH8	Q99549	860 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	THUMPD2	Q9BTF0	503 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ABCB6	Q9NP58	842 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	TUBGCP6	Q96RT7	1819 aa		10.1	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	COL3A1	P02461	1466 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MLH3	Q9UHC1	1453 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	MPHOSPH10	O00566	681 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCP110	O43303	1012 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	PREPL	Q4J6C6	727 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CFAP70	Q5T0N1	1121 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	LARP1B	Q659C4	914 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCDC102A	Q96A19	550 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CABS1	Q96KC9	395 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	RAB21	Q9UL25	225 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	EVC2	Q86UK5	1308 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KIAA0232	Q92628	1395 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	USP32	Q8NFA0	1604 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CCT5	P48643	541 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	GRIK3	Q13003	919 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	DHX8	Q14562	1220 aa	Known RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	CASP8	Q14790	479 aa		10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	ZNF483	Q8TF39	744 aa	Predicted RBP	10.09	□□□□□ -0.79
CNTNAP2-222	ENST00000637694	KCNB2	Q92953	911 aa		10.09	□□□□□ -0.79

Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 32.3 ms