RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000613122.4

CTDP1-208, Transcript of CTD phosphatase subunit 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene CTDP1, Length 5,866 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC91Q7Z6B0 441 aa23.15■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 HOOK3Q86VS8 718 aa23.14■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 ANKRD44Q8N8A2 993 aa23.14■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 TNNT1P13805 278 aa23.14■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 HDAC1Q13547 482 aaPredicted RBP23.14■■□□□ 1.3
CTDP1-208ENST00000613122 HOXC9P31274 260 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 NUP153P49790 1475 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CA8P35219 290 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 PAFAH1B1P43034 410 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 IP6K1Q92551 441 aa23.14■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP23.14■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 UGGT2Q9NYU1 1516 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 PEG3Q9GZU2 1588 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 PDE1AP54750 535 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 IL27Q8NEV9 243 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CRACR2AQ9BSW2 395 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 RNMTO43148 476 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 SDSP20132 328 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 LDHBP07195 334 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 USP37Q86T82 979 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 MCM9Q9NXL9 1143 aa23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 RBM10P98175 930 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP23.13■■□□□ 1.29
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CTDP1-208ENST00000613122 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP23.13■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 EYA1Q99502 592 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 LRRC2Q9BYS8 371 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 ALS2CR12Q96Q35 445 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D2Q9BYX2 928 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 TBX22Q9Y458 520 aa23.12■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CALM1P0DP23 149 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CALM2P0DP24 149 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CALM3P0DP25 149 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 TNNI2P48788 182 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 TRIM47Q96LD4 638 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 GDPD2Q9HCC8 539 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CCNL1Q9UK58 526 aaPredicted RBP23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 C6orf50Q9HD87 102 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 STAT6P42226 847 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC113Q9H0I3 377 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 MMRN2Q9H8L6 949 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 PRAG1Q86YV5 1406 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 MAGEB6Q8N7X4 407 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CNBD1Q8NA66 436 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 RTL9Q8NET4 1388 aa23.11■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 EIF4G3O43432 1585 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 IGHDP01880 384 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 GOPCQ9HD26 462 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 DYDC1Q8WWB3 177 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 RRP36Q96EU6 259 aaKnown RBP23.1■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 TMCO5BA8MYB1 307 aa23.1■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa23.1■■□□□ 1.29
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CTDP1-208ENST00000613122 SPDYE3A6NKU9 549 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 ZFYVE9O95405 1425 aa23.09■■□□□ 1.29
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CTDP1-208ENST00000613122 RBM27Q9P2N5 1060 aaKnown RBP23.09■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 URI1O94763 535 aaPredicted RBP23.09■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 CCDC172P0C7W6 258 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 MAP9Q49MG5 647 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 Q6ZUG5 572 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 FERMT1Q9BQL6 677 aa23.09■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 SYKP43405 635 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 MCM3P25205 808 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 ISM2Q6H9L7 571 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP23.08■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 TMC6Q7Z403 805 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 KIF18AQ8NI77 898 aa23.08■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 YTHDC2Q9H6S0 1430 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.29
CTDP1-208ENST00000613122 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa23.08■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP23.08■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 TTC41PQ6P2S7 1318 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 PHACTR2O75167 634 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 KRT13P13646 458 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 IFFO1Q0D2I5 559 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 NOP2P46087 812 aaKnown RBP23.07■■□□□ 1.28
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CTDP1-208ENST00000613122 RRAGBQ5VZM2 374 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 TAOK3Q9H2K8 898 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 TFCP2Q12800 502 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 TBC1D5Q92609 795 aa23.07■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 POLR3AO14802 1390 aaPredicted RBP23.06■■□□□ 1.28
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CTDP1-208ENST00000613122 NEMFO60524 1076 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 NCBP1Q09161 790 aaKnown RBP23.06■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 KCNG4Q8TDN1 519 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 SYNCQ9H7C4 482 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 COMMD10Q9Y6G5 202 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 GJA3Q9Y6H8 435 aa23.06■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 TCEANC2Q96MN5 208 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 ESPNB1AK53 854 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 AFMP43652 599 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 TMCO3Q6UWJ1 677 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 PARP10Q53GL7 1025 aa23.05■■□□□ 1.28
CTDP1-208ENST00000613122 TMX3Q96JJ7 454 aa23.05■■□□□ 1.28
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