RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000590546.6

USP36-218, Transcript of ubiquitin specific peptidase 36, humanhuman

TSL 1 (best) BASIC

Gene USP36, Length 1,771 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP36-218ENST00000590546 PTH1RQ03431 593 aa26.96■■□□□ 1.91
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USP36-218ENST00000590546 FAM182BQ5T319 152 aa26.94■■□□□ 1.9
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USP36-218ENST00000590546 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.94■■□□□ 1.9
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USP36-218ENST00000590546 ZPR1O75312 459 aa26.93■■□□□ 1.9
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USP36-218ENST00000590546 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.92■■□□□ 1.9
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USP36-218ENST00000590546 ADORA1P30542 326 aa26.9■■□□□ 1.9
USP36-218ENST00000590546 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.9■■□□□ 1.9
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USP36-218ENST00000590546 TMX3Q96JJ7 454 aa26.89■■□□□ 1.9
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USP36-218ENST00000590546 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.89■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 SETDB2Q96T68 719 aa26.89■■□□□ 1.89
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USP36-218ENST00000590546 SLC27A2O14975 620 aa26.86■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 SLC5A1P13866 664 aa26.86■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 TTC14Q96N46 770 aa26.86■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.86■■□□□ 1.89
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USP36-218ENST00000590546 KRT32Q14532 448 aa26.85■■□□□ 1.89
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USP36-218ENST00000590546 SLC27A3Q5K4L6 730 aa26.85■■□□□ 1.89
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USP36-218ENST00000590546 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.85■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 CYP46A1Q9Y6A2 500 aa26.85■■□□□ 1.89
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USP36-218ENST00000590546 VPS53Q5VIR6 699 aa26.84■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.84■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 ZSCAN25Q6NSZ9 544 aa26.84■■□□□ 1.89
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USP36-218ENST00000590546 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
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USP36-218ENST00000590546 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP26.83■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 TPTE2Q6XPS3 522 aa26.83■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 GBP4Q96PP9 640 aa26.83■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 DSCC1Q9BVC3 393 aa26.83■■□□□ 1.89
USP36-218ENST00000590546 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.82■■□□□ 1.88
USP36-218ENST00000590546 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.82■■□□□ 1.88
USP36-218ENST00000590546 DDX24Q9GZR7 859 aaKnown RBP eCLIP26.82■■□□□ 1.882e-7■■■□□ 17.3
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USP36-218ENST00000590546 MCM4P33991 863 aa26.81■■□□□ 1.88
USP36-218ENST00000590546 RUFY3Q7L099 469 aa26.81■■□□□ 1.88
USP36-218ENST00000590546 NBPF5PQ86XG9 351 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
USP36-218ENST00000590546 ANKRD18AQ8IVF6 992 aa26.81■■□□□ 1.88
USP36-218ENST00000590546 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.81■■□□□ 1.88
USP36-218ENST00000590546 LIMCH1Q9UPQ0 1083 aa26.81■■□□□ 1.88
USP36-218ENST00000590546 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.81■■□□□ 1.88
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