RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000588972.1

ATG4D-210, Transcript of autophagy related 4D cysteine peptidase, humanhuman

TSL 5

Gene ATG4D, Length 632 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4D-210ENST00000588972 NRXN3Q9Y4C0 1643 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 MST1RQ04912 1400 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 ZBTB39O15060 712 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 PLCB3Q01970 1234 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 EHHADHQ08426 723 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 FAM26DQ5JW98 314 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 LIAT1Q6ZQX7 453 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 HRH3Q9Y5N1 445 aa11.13□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 GPR182O15218 404 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 TLR1Q15399 786 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 ABTB2Q8N961 1025 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 CHMP3Q9Y3E7 222 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 EMILIN1Q9Y6C2 1016 aa11.12□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 HFM1A2PYH4 1435 aa11.11□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 LDHBP07195 334 aaKnown RBP11.11□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 MAPK8P45983 427 aa11.11□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 CNKSR1Q969H4 720 aa11.11□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 EMID1Q96A84 441 aaPredicted RBP11.11□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 ESYT1Q9BSJ8 1104 aa11.11□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 ADGRL3Q9HAR2 1447 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 NALCNQ8IZF0 1738 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 EML1O00423 815 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 WNT7AO00755 349 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 BRD2P25440 801 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 ATCAYQ86WG3 371 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 CDAN1Q8IWY9 1227 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 MRGPRX2Q96LB1 330 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 PNPLA6Q8IY17 1366 aa11.1□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 SERTM1A2A2V5 107 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 ADH1AP07327 375 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 RBM6P78332 1123 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 FGD1P98174 961 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 PDE3BQ13370 1112 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 TEAD4Q15561 434 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 LDLRAD1Q5T700 205 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 SH3PXD2AQ5TCZ1 1133 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 LRRC59Q96AG4 307 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 ALKBH8Q96BT7 664 aaKnown RBP11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 NGLY1Q96IV0 654 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 HCSTQ9UBK5 93 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 SPHKAPQ2M3C7 1700 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 LAMC1P11047 1609 aa11.09□□□□□ -0.63
ATG4D-210ENST00000588972 SCAMP3O14828 347 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 NBPF15Q8N660 670 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 FAM161BQ96MY7 647 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP11.08□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP11.08□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 PARP2Q9UGN5 583 aa11.08□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 NOS2P35228 1153 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP11.07□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 CLN3Q13286 438 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 SREK1Q8WXA9 508 aaKnown RBP11.07□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 RNF19AQ9NV58 838 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 POLIQ9UNA4 740 aa11.07□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 NUP155O75694 1391 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 HDLBPQ00341 1268 aaKnown RBP11.06□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 ALDH16A1Q8IZ83 802 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 GJD3Q8N144 294 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 WWC3Q9ULE0 1092 aa11.06□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 METP08581 1390 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 ERCC5P28715 1186 aaPredicted RBP11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 CBLBQ13191 982 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 RTN1Q16799 776 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 C11orf91Q3C1V1 193 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 TMC4Q7Z404 712 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 L3MBTL2Q969R5 705 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 SETDB2Q96T68 719 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 NIF3L1Q9GZT8 377 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 ZNF232Q9UNY5 417 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 HCN4Q9Y3Q4 1203 aa11.05□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 NEXMIFQ5QGS0 1516 aa11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 PTCH1Q13635 1447 aa11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 DAB2P98082 770 aa11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 CENPCQ03188 943 aa11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 DGKZQ13574 1117 aa11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 NAALADL2Q58DX5 795 aa11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 DDX17Q92841 729 aaKnown RBP11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 DRC1Q96MC2 740 aa11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 CABP1Q9NZU7 370 aa11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 C1orf167Q5SNV9 1468 aa11.04□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP11.03□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 ATP2B2Q01814 1243 aa11.03□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 NNTQ13423 1086 aa11.03□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 ENOX2Q16206 610 aaKnown RBP11.03□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 EDEM1Q92611 657 aa11.03□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 KLK14Q9P0G3 267 aa11.03□□□□□ -0.64
ATG4D-210ENST00000588972 ADAMTS2O95450 1211 aa11.02□□□□□ -0.65
ATG4D-210ENST00000588972 PDGFAP04085 211 aa11.02□□□□□ -0.65
ATG4D-210ENST00000588972 PTGIRP43119 386 aa11.02□□□□□ -0.65
ATG4D-210ENST00000588972 ZAP70P43403 619 aa11.02□□□□□ -0.65
ATG4D-210ENST00000588972 USP5P45974 858 aa11.02□□□□□ -0.65
ATG4D-210ENST00000588972 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 65 ms