RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000585685.5

APOC4-APOC2-201, Transcript of APOC4-APOC2 readthrough (NMD candidate), humanhuman

TSL 5

Gene APOC4-APOC2, Length 1,829 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa19.66■□□□□ 0.74
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CSF1RP07333 972 aa19.65■□□□□ 0.74
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP19.65■□□□□ 0.74
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NEK1Q96PY6 1258 aa19.65■□□□□ 0.74
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa19.64■□□□□ 0.73
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC158Q5M9N0 1113 aa19.6■□□□□ 0.73
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 VPS37CA5D8V6 355 aaPredicted RBP19.6■□□□□ 0.73
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 NLRP10Q86W26 655 aa19.6■□□□□ 0.73
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP19.59■□□□□ 0.73
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APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LTBP4Q8N2S1 1624 aa19.56■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 IL6STP40189 918 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 STK3Q13188 491 aa19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ELP1O95163 1332 aa19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CTSWP56202 376 aa19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 KRT85P78386 507 aa19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GORABQ5T7V8 394 aa19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LRP5O75197 1615 aa19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP19.55■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 M0R2C6 588 aa19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ITGA6P23229 1130 aa19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 GPTP24298 496 aa19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ARAP2Q8WZ64 1704 aa19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 RREB1Q92766 1687 aa19.54■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 SYNE4Q8N205 404 aa19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 FAM184AQ8NB25 1140 aa19.53■□□□□ 0.72
APOC4-APOC2-201ENST00000585685 BRF1Q92994 677 aa19.53■□□□□ 0.72
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