RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000578600.1

PTPRM-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 578 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-208ENST00000578600 PCDHGC4Q9Y5F7 938 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 AKNAQ7Z591 1439 aa8.42□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 FANCAO15360 1455 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 YEATS2Q9ULM3 1422 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 PLEKHD1A6NEE1 506 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 PRPF40AO75400 957 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 SNRPBP14678 240 aaKnown RBP8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 TNP2Q05952 138 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 FIGNL1Q6PIW4 674 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 TTC16Q8NEE8 873 aa8.41□□□□□ -1.06
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PTPRM-208ENST00000578600 IGSF5Q9NSI5 407 aa8.41□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 MAGI2Q86UL8 1455 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 PNMA6FA0A0J9YX94 578 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 H7C1W4 665 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 TNFRSF21O75509 655 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 NEFLP07196 543 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 ITGAEP38570 1179 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 ATP2B2Q01814 1243 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.4□□□□□ -1.06
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PTPRM-208ENST00000578600 ELP3Q9H9T3 547 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 KCNH4Q9UQ05 1017 aa8.4□□□□□ -1.06
PTPRM-208ENST00000578600 ADAMTSL3P82987 1691 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 KIAA0556O60303 1618 aa8.4□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 XYLBO75191 536 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 HSPA2P54652 639 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 LAMC2Q13753 1193 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 ALG1LQ6GMV1 187 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 ZNF837Q96EG3 531 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 GMCL1Q96IK5 515 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 RNF19AQ9NV58 838 aa8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 DENND4BO75064 1496 aaPredicted RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 BNIP3LO60238 219 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 MAPTP10636 758 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 ITGA6P23229 1130 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
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PTPRM-208ENST00000578600 ILDR2Q71H61 639 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 NLRP13Q86W25 1043 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 GSX2Q9BZM3 304 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 MRS2Q9HD23 443 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 STRN4Q9NRL3 753 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 PARP2Q9UGN5 583 aa8.38□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 DCDC2BA2VCK2 349 aa8.37□□□□□ -1.07
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PTPRM-208ENST00000578600 GRIN2CQ14957 1233 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRM-208ENST00000578600 TMC4Q7Z404 712 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 CNTN3Q9P232 1028 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 USP35Q9P2H5 1018 aa8.36□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 IQSEC2Q5JU85 1478 aa8.36□□□□□ -1.07
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PTPRM-208ENST00000578600 SASH3O75995 380 aa8.35□□□□□ -1.07
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PTPRM-208ENST00000578600 ABHD17AQ96GS6 310 aa8.35□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 ATP10BO94823 1461 aa8.34□□□□□ -1.07
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PTPRM-208ENST00000578600 PHACTR2O75167 634 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 LDLRAD1Q5T700 205 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 Q6ZNB5 142 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 GTPBP3Q969Y2 492 aaKnown RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
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PTPRM-208ENST00000578600 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 CDK11AQ9UQ88 783 aaPredicted RBP8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 PTPRTO14522 1441 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 BCORL1Q5H9F3 1711 aa8.34□□□□□ -1.07
PTPRM-208ENST00000578600 C11orf95C9JLR9 678 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 TARSP26639 723 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 PSMD2Q13200 908 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 UHRF1BP1Q6BDS2 1440 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 FAM161BQ96MY7 647 aa8.33□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 ABCA9Q8IUA7 1624 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 POTECB2RU33 542 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 EREGO14944 169 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 SORBS3O60504 671 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 GNA15P30679 374 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 SPEM2Q0P670 501 aa8.32□□□□□ -1.08
PTPRM-208ENST00000578600 FAM182BQ5T319 152 aa8.32□□□□□ -1.08
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