RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000572588.1

MKL2-206, Transcript of MKL/myocardin-like protein 2, human

TSL 1 (best)

Gene MKL2, Length 7,897 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MKL2-206	ENST00000572588	BEGAIN	Q9BUH8	593 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TUT1	Q9H6E5	874 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PPCS	Q9HAB8	311 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PRMT3	O60678	531 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NASP	P49321	788 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	FAM98C	Q17RN3	349 aa	Known RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PLA2G4E	Q3MJ16	856 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ZNF467	Q7Z7K2	595 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PCDHB15	Q9Y5E8	787 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ABCC6	O95255	1503 aa		3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	KDM6A	O15550	1401 aa	Predicted RBP	3.59	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	GOLGA6L6	A8MZA4	724 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	GCKR	Q14397	625 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	HELB	Q8NG08	1087 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MEIS3	Q99687	375 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	METTL22	Q9BUU2	404 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	USP44	Q9H0E7	712 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CHPF2	Q9P2E5	772 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	LRP2BP	Q9P2M1	347 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SETD1B	Q9UPS6	1966 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	BCL9	O00512	1426 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MEGF6	O75095	1541 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ERVV-1	B6SEH8	477 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MAP3K11	Q16584	847 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ISCA1	Q9BUE6	129 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ZBTB3	Q9H5J0	574 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	QTRT2	Q9H974	415 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	COPRS	Q9NQ92	184 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	LOC102724428	A0A0B4J2F2	783 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SKI	P12755	728 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SIK1	P57059	783 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NAA30	Q147X3	362 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	EXOC8	Q8IYI6	725 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	DHX38	Q92620	1227 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	AKAP12	Q02952	1782 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	BCL9L	Q86UU0	1499 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	HSP90AA1	P07900	732 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PDIA6	Q15084	440 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	RC3H1	Q5TC82	1133 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ERC1	Q8IUD2	1116 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SETD1A	O15047	1707 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SH3TC1	Q8TE82	1336 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CDHR2	Q9BYE9	1310 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CYP19A1	P11511	503 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SP5	Q6BEB4	398 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	KRT27	Q7Z3Y8	459 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC191	Q8NCU4	936 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	GPR108	Q9NPR9	543 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MAP2	P11137	1827 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	LTBP4	Q8N2S1	1624 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	DHX16	O60231	1041 aa	Known RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PSEN1	P49768	467 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ZNF211	Q13398	564 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	C9orf78	Q9NZ63	289 aa	Predicted RBP	3.58	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SURF6	O75683	361 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	A1BG	P04217	495 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	AMPD1	P23109	780 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CERS3	Q8IU89	383 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NECTIN2	Q92692	538 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SYTL4	Q96C24	671 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	DRC1	Q96MC2	740 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ASAP1	Q9ULH1	1129 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	IGKV5-2	P06315	115 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PROSER3	Q2NL68	480 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CEP85	Q6P2H3	762 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	GLMN	Q92990	594 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TRIM11	Q96F44	468 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NOL10	Q9BSC4	688 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CCNL1	Q9UK58	526 aa	Predicted RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CEP83	Q9Y592	693 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PALLD	Q8WX93	1383 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	RIMS1	Q86UR5	1692 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CNTNAP4	Q9C0A0	1308 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	DIAPH2	O60879	1101 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	FLAD1	Q8NFF5	587 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	RHPN1	Q8TCX5	695 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CCDC102A	Q96A19	550 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	FAM50B	Q9Y247	325 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TRIM17	Q9Y577	477 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	NRK	Q7Z2Y5	1582 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PRRC2B	Q5JSZ5	2229 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TRAK2	O60296	914 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MCC	P23508	829 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SSR1	P43307	286 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	SLFNL1	Q499Z3	407 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	CC2D2B	Q6DHV5	1058 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	ATL2	Q8NHH9	583 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PPM1E	Q8WY54	764 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	DCBLD2	Q96PD2	775 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	TXNRD1	Q16881	649 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	MYD88	Q99836	296 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	EYA2	O00167	538 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	EPB41L2	O43491	1005 aa	Known RBP	3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	BAG6	P46379	1132 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MKL2-206	ENST00000572588	LMBR1L	Q6UX01	489 aa		3.57	□□□□□ -1.84

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