RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000569223.1

EHD4-202, Transcript of EH domain containing 4, humanhuman

TSL 2

Gene EHD4, Length 2,032 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EHD4-202ENST00000569223 CCDC57Q2TAC2 916 aa27.59■■■□□ 2.01
EHD4-202ENST00000569223 PLA2G12BQ9BX93 195 aa27.59■■■□□ 2.01
EHD4-202ENST00000569223 LAMA4Q16363 1823 aa27.59■■■□□ 2.01
EHD4-202ENST00000569223 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
EHD4-202ENST00000569223 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP27.58■■■□□ 2.01
EHD4-202ENST00000569223 TSPY26PQ9H489 355 aa27.58■■■□□ 2.01
EHD4-202ENST00000569223 CEP126Q9P2H0 1117 aa27.58■■■□□ 2.01
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EHD4-202ENST00000569223 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa27.58■■■□□ 2.01
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EHD4-202ENST00000569223 FBXO3Q9UK99 471 aa27.57■■■□□ 2
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EHD4-202ENST00000569223 LRP6O75581 1613 aa27.57■■■□□ 2
EHD4-202ENST00000569223 CSPP1Q1MSJ5 1256 aa27.57■■■□□ 2
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EHD4-202ENST00000569223 PDCP20941 246 aa27.56■■■□□ 2
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EHD4-202ENST00000569223 CSF1RP07333 972 aa27.55■■■□□ 2
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EHD4-202ENST00000569223 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP27.53■■■□□ 2
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EHD4-202ENST00000569223 CDHR2Q9BYE9 1310 aa27.52■■■□□ 2
EHD4-202ENST00000569223 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP27.52■■■□□ 2
EHD4-202ENST00000569223 HLFQ16534 295 aa27.52■■■□□ 2
EHD4-202ENST00000569223 SLC4A9Q96Q91 983 aa27.52■■■□□ 2
EHD4-202ENST00000569223 ADORA1P30542 326 aa27.51■■■□□ 2
EHD4-202ENST00000569223 RNF214Q8ND24 703 aa27.51■■■□□ 2
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EHD4-202ENST00000569223 CCDC158Q5M9N0 1113 aa27.51■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 XAGE2Q96GT9 111 aa27.51■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 TPRNQ4KMQ1 711 aa27.5■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 TTC39AQ5SRH9 613 aa27.5■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 NLRP10Q86W26 655 aa27.5■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 COL22A1Q8NFW1 1626 aaPredicted RBP27.5■■□□□ 1.99
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EHD4-202ENST00000569223 M0R2C6 588 aa27.49■■□□□ 1.99
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EHD4-202ENST00000569223 HSP90AB3PQ58FF7 597 aa27.48■■□□□ 1.99
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EHD4-202ENST00000569223 NUP98P52948 1817 aa27.48■■□□□ 1.99
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EHD4-202ENST00000569223 LRRC2Q9BYS8 371 aa27.48■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 JAK2O60674 1132 aa27.47■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 KRT85P78386 507 aa27.47■■□□□ 1.99
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EHD4-202ENST00000569223 ZBTB1Q9Y2K1 713 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 EXOC5O00471 708 aa27.46■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 A0A0G2JLW4 131 aa27.45■■□□□ 1.99
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EHD4-202ENST00000569223 OSBP2Q969R2 916 aa27.45■■□□□ 1.99
EHD4-202ENST00000569223 MYH7P12883 1935 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 DOT1LQ8TEK3 1739 aa27.45■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 EXOSC10Q01780 885 aaKnown RBP27.45■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 SCARF1Q14162 830 aa27.45■■□□□ 1.98
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EHD4-202ENST00000569223 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 NWD2Q9ULI1 1742 aa27.43■■□□□ 1.98
EHD4-202ENST00000569223 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP27.43■■□□□ 1.98
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