RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000559861.1

USP3-AS1-204, USP3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene USP3-AS1, Length 620 nt, Biotype antisense RNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP3-AS1-204ENST00000559861 GPR25O00155 361 aa13.7□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATXN7O15265 892 aaPredicted RBP13.7□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFHR5Q9BXR6 569 aa13.7□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 BCS1LQ9Y276 419 aa13.7□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 RTEL1-TNFRSF6BF6WH68 1400 aa13.7□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 BNIP3LO60238 219 aa13.69□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 IER5Q5VY09 327 aa13.69□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTMR7Q9Y216 660 aa13.69□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 TGFBR3LH3BV60 316 aa13.68□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM157BP0CG42 384 aa13.68□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARID4AP29374 1257 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 ATXN7L1Q9ULK2 861 aaPredicted RBP13.68□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 PHF24Q9UPV7 400 aa13.68□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 NLRP1Q9C000 1473 aa13.67□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABHD17AQ96GS6 310 aa13.67□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 MROH1Q8NDA8 1641 aa13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNFRSF10BO14763 440 aa13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 HNRNPMP52272 730 aaKnown RBP eCLIP13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNP2Q05952 138 aa13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 GAS6Q14393 721 aa13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 BTLAQ7Z6A9 289 aa13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 IFT43Q96FT9 208 aa13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 DMGDHQ9UI17 866 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 TNRQ92752 1358 aa13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 XIRP1Q702N8 1843 aaKnown RBP13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCDC141Q6ZP82 1450 aa13.66□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 EFSO43281 561 aa13.65□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 PDIA4P13667 645 aaKnown RBP13.65□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 HSPA1LP34931 641 aa13.65□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 GMPRP36959 345 aa13.65□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 TXNDC2Q86VQ3 553 aa13.65□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP13.65□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCNB3Q8WWL7 1395 aa13.65□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 ARHGEF5Q12774 1597 aa13.65□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 UGGT1Q9NYU2 1555 aa13.65□□□□□ -0.22
USP3-AS1-204ENST00000559861 CEP162Q5TB80 1403 aa13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 EIF2AK4Q9P2K8 1649 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 DCDC2BA2VCK2 349 aa13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAPTP10636 758 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 BRD2P25440 801 aaKnown RBP13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 TYRO3Q06418 890 aa13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 RNFT1Q5M7Z0 435 aa13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 HELQQ8TDG4 1101 aa13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 UBR1Q8IWV7 1749 aa13.64□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 CAMSAP2Q08AD1 1489 aa13.63□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 DHX29Q7Z478 1369 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 KHNYNO15037 678 aaKnown RBP13.63□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 CEP63Q96MT8 703 aa13.63□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 STIM2Q9P246 746 aa13.63□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 HCN2Q9UL51 889 aa13.63□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 DNMT3AQ9Y6K1 912 aaPredicted RBP13.63□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 MAST1Q9Y2H9 1570 aa13.62□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 KRT76Q01546 638 aa13.62□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 LAMC2Q13753 1193 aa13.62□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 CFDP1Q9UEE9 299 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABCC3O15438 1527 aa13.62□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 LRRC7Q96NW7 1537 aa13.62□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP13.62□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 MICAL2O94851 1124 aa13.61□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 FGFR3P22607 806 aa13.61□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM26DQ5JW98 314 aa13.61□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 GGT6Q6P531 493 aa13.61□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 ETFBKMTQ8IXQ9 262 aa13.61□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 BRD7Q9NPI1 651 aa13.61□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 CEP152O94986 1710 aa13.61□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTUS2Q5JR59 1369 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 INPP5BP32019 993 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 SERPINB4P48594 390 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 IDH3AP50213 366 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNQ4P56696 695 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 TREML1Q86YW5 311 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 HOMEZQ8IX15 550 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 STRN4Q9NRL3 753 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 MBIPQ9NS73 344 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 EGFL7Q9UHF1 273 aa13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 ZNF644Q9H582 1327 aaPredicted RBP13.59□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP13.58□□□□□ -0.23
USP3-AS1-204ENST00000559861 MIA2Q96PC5 1412 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 MX2P20592 715 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 FAM182BQ5T319 152 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNTNAP3BQ96NU0 1288 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 ERVK-7P63135 1459 aa13.58□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 NCOA2Q15596 1464 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABL1P00519 1130 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 KCNA1Q09470 495 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 MTMR3Q13615 1198 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 ABTB2Q8N961 1025 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 MARK1Q9P0L2 795 aa13.57□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 PRDM15P57071 1507 aaPredicted RBP13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 OPLAHO14841 1288 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 WIPF1O43516 503 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 TOM1O60784 492 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 CD33P20138 364 aa13.56□□□□□ -0.24
USP3-AS1-204ENST00000559861 CTBSQ01459 385 aa13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.8 ms