RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000539903.5

RSPH10B-208, Transcript of radial spoke head 10 homolog B, human

TSL 5 BASIC

Gene RSPH10B, Length 2,881 nt, Biotype protein coding.

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RSPH10B-208	ENST00000539903	BOLA2	Q9H3K6	86 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	CLIP2	Q9UDT6	1046 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	PLCH1	Q4KWH8	1693 aa		13.43	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	BTBD11	A6QL63	1104 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	ANKRD1	Q15327	319 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	FSD1	Q9BTV5	496 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	NRAP	Q86VF7	1730 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	COL15A1	P39059	1388 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	PRAMEF22	A3QJZ6	481 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	HIP1	O00291	1037 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	ALDH1L1	O75891	902 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	REST	Q13127	1097 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	BICD2	Q8TD16	824 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	BICC1	Q9H694	974 aa	Known RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	DBF4	Q9UBU7	674 aa	Predicted RBP	13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	CAMTA1	Q9Y6Y1	1673 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	DDX11	Q96FC9	970 aa		13.42	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	MYH15	Q9Y2K3	1946 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	KSR2	Q6VAB6	950 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	EDC3	Q96F86	508 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	CTNNA3	Q9UI47	895 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	TNKS1BP1	Q9C0C2	1729 aa	Known RBP	13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	ARID5B	Q14865	1188 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	SYCP1	Q15431	976 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	RNF20	Q5VTR2	975 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	MPRIP	Q6WCQ1	1025 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	KLHDC4	Q8TBB5	520 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	SIL1	Q9H173	461 aa		13.41	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	SLIT2	O94813	1529 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	USP27X	A6NNY8	438 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	IQCB1	Q15051	598 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	C11orf57	Q6ZUT1	292 aa	Predicted RBP	13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	BRF1	Q92994	677 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	GTF3C6	Q969F1	213 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	TEF	Q10587	303 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	TSGA10IP	Q3SY00	556 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	IP6K1	Q92551	441 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	FEZ1	Q99689	392 aa		13.4	□□□□□ -0.26
RSPH10B-208	ENST00000539903	RGPD5	Q99666	1765 aa		13.4	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	GIGYF1	O75420	1035 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	TAF5L	O75529	589 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CDC25B	P30305	580 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	TPD52L1	Q16890	204 aa	Predicted RBP	13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	GRM8	O00222	908 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	KIF20A	O95235	890 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CHGB	P05060	677 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	G3BP1	Q13283	466 aa	Known RBP eCLIP	13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	LRRC8A	Q8IWT6	810 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	OGFR	Q9NZT2	677 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	PAXBP1	Q9Y5B6	917 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	NCAPD2	Q15021	1401 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	MRC1	P22897	1456 aa		13.39	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	ZNF530	Q6P9A1	599 aa	Predicted RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CCDC112	Q8NEF3	446 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	HMG20B	Q9P0W2	317 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	UTY	O14607	1347 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903		A0A087WWV3	80 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	AKAP4	Q5JQC9	854 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	USPL1	Q5W0Q7	1092 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	FTO	Q9C0B1	505 aa	Known RBP eCLIP	13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	HEG1	Q9ULI3	1381 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	ADD1	P35611	737 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CEBPZ	Q03701	1054 aa	Known RBP	13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CEP135	Q66GS9	1140 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	SARM1	Q6SZW1	724 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	GOLPH3L	Q9H4A5	285 aa		13.38	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	COL5A2	P05997	1499 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	ZFP91-CNTF	A0A0A6YYC7	529 aa	Predicted RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	LINS1	Q8NG48	757 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	ZNF592	Q92610	1267 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	NDUFB9	Q9Y6M9	179 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CCDC129	Q6ZRS4	1044 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903		Q6ZUG5	572 aa		13.37	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	DDX41	Q9UJV9	622 aa	Known RBP	13.37	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	LAMA4	Q16363	1823 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	RNMT	O43148	476 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	ZC3H6	P61129	1189 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	SCRN1	Q12765	414 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	IGKV5-2	P06315	115 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	RBM6	P78332	1123 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	NYAP1	Q6ZVC0	841 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	MRFAP1L1	Q96HT8	127 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	NEK1	Q96PY6	1258 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	LRRC2	Q9BYS8	371 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CGN	Q9P2M7	1197 aa	Known RBP	13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	ZNF609	O15014	1411 aa		13.36	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903		H3BQV1	296 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	FOSB	P53539	338 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	AIMP1	Q12904	312 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	EPHA10	Q5JZY3	1008 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	IFFO2	Q5TF58	517 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	DHX40	Q8IX18	779 aa	Known RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	FNBP4	Q8N3X1	1017 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	PRDM11	Q9NQV5	511 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	USP16	Q9Y5T5	823 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	SIPA1L3	O60292	1781 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	GOLGA6L19	H0YKK7	550 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CAVIN2	O95810	425 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CCZ1B	P86790	482 aa		13.35	□□□□□ -0.27
RSPH10B-208	ENST00000539903	CCZ1	P86791	482 aa	Predicted RBP	13.35	□□□□□ -0.27

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