RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534638.1

ME3-211, Transcript of malic enzyme 3, humanhuman

TSL 4

Gene ME3, Length 565 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ME3-211ENST00000534638 SNTG2Q9NY99 539 aa5.13□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 CABP1Q9NZU7 370 aa5.13□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 EFR3BQ9Y2G0 817 aa5.13□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 USP20Q9Y2K6 914 aa5.13□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 SENP3-EIF4A1A0A087X0R7 540 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 WIPF1O43516 503 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 DNAJC6O75061 913 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 POU4F2Q12837 409 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 POTEAQ6S8J7 498 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 KIAA0825Q8IV33 1275 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 RASGRP4Q8TDF6 673 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 L3MBTL2Q969R5 705 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 XAGE2Q96GT9 111 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 TRIM56Q9BRZ2 755 aaKnown RBP5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 CHPF2Q9P2E5 772 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 FAM8A1Q9UBU6 413 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 ADAMTS1Q9UHI8 967 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 BCS1LQ9Y276 419 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 RIPOR2Q9Y4F9 1068 aa5.12□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 MINDY4BA8MYZ0 360 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 CDK2AP1O14519 115 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 TNFRSF21O75509 655 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 VSIG8P0DPA2 414 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 ST13P50502 369 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 CENPCQ03188 943 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 RASA3Q14644 834 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 TEAD4Q15561 434 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 NBPF6Q5VWK0 638 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 KLRG1Q96E93 195 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 NBPF4Q96M43 638 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 DEPDC7Q96QD5 511 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 BCO2Q9BYV7 579 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 SPC25Q9HBM1 224 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 GINM1Q9NU53 330 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 FANCLQ9NW38 375 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 TTF2Q9UNY4 1162 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 HRH3Q9Y5N1 445 aa5.11□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 LOC102724159A0A0B4J2E5 919 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 TPD52L2O43399 206 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 GADD45BO75293 160 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 PEX14O75381 377 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 NEFLP07196 543 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 ITGA6P23229 1130 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 TXLNAP40222 546 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 PWP2Q15269 919 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 MAP3K11Q16584 847 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 SH3TC2Q8TF17 1288 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 STAG1Q8WVM7 1258 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 ANAPC16Q96DE5 110 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 ZSCAN10Q96SZ4 725 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 PSMD1Q99460 953 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 BRINP2Q9C0B6 783 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 FHDC1Q9C0D6 1143 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 IRF2BPLQ9H1B7 796 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 SIRPGQ9P1W8 387 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 GABBR1Q9UBS5 961 aa5.1□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 ESYT3A0FGR9 886 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 CDC14CA4D256 554 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 SPATA31C2B4DYI2 1134 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 KLF4O43474 513 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 CDC45O75419 566 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 S100BP04271 92 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 GTF2E1P29083 439 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 CHMP4BP1P59074 171 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 INSM1Q01101 510 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 AMPD3Q01432 767 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 RAB33AQ14088 237 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 PLEKHG4Q58EX7 1191 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 TMEM214Q6NUQ4 689 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 NBPF10Q6P3W6 841 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 ZNF295-AS1Q8N0V1 137 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 VWA5B2Q8N398 1253 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 NBPF15Q8N660 670 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 GPR161Q8N6U8 529 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 NANOS1Q8WY41 292 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 MKL1Q969V6 931 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 EAF1Q96JC9 268 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 SEC16BQ96JE7 1060 aa5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 DDX56Q9NY93 547 aaKnown RBP5.09□□□□□ -1.59
ME3-211ENST00000534638 PLEKHD1A6NEE1 506 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 GIPC1O14908 333 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 PHACTR2O75167 634 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 FBXO24O75426 580 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 MICAL2O94851 1124 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 GBP2P32456 591 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 PHKA2P46019 1235 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 FAM160A1Q05DH4 1040 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 TRIP4Q15650 581 aaPredicted RBP5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 HSP90AB2PQ58FF8 381 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 WDR44Q5JSH3 913 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 GNASQ5JWF2 1037 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 CCDC181Q5TID7 509 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 CCDC81Q6ZN84 652 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 SV2AQ7L0J3 742 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 ZNF438Q7Z4V0 828 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 EXOC8Q8IYI6 725 aa5.08□□□□□ -1.6
ME3-211ENST00000534638 SNX29Q8TEQ0 813 aa5.08□□□□□ -1.6
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms