RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000523364.1

HOXA-AS2-209, HOXA cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene HOXA-AS2, Length 989 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZBTB3Q9H5J0 574 aa14.7□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RBBP6Q7Z6E9 1792 aaKnown RBP14.7□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MAP3K15Q6ZN16 1313 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DUOX1Q9NRD9 1551 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ERVV-1B6SEH8 477 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 BBOX1O75936 387 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MYCP01106 439 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RPS12P25398 132 aaKnown RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CAP1Q01518 475 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SREBF2Q12772 1141 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TTLL12Q14166 644 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CD99L2Q8TCZ2 262 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TMEM106CQ9BVX2 250 aa14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IBTKQ9P2D0 1353 aaPredicted RBP14.69□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ECE2O60344 883 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PPP2R1AP30153 589 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 WASHC4Q2M389 1173 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF34Q8IZ26 560 aa14.68□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PITPNM2Q9BZ72 1349 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SOX1O00570 391 aaPredicted RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KIF6Q6ZMV9 814 aa14.67□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RTF1Q92541 710 aaKnown RBP14.67□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CEP290O15078 2479 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LAMB4A4D0S4 1761 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 U2AF1L5P0DN76 240 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 U2AF1Q01081 240 aaKnown RBP eCLIP14.66□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SLC4A8Q2Y0W8 1093 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LRCH3Q96II8 777 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF333Q96JL9 665 aa14.66□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZBTB4Q9P1Z0 1013 aaPredicted RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RRP7AQ9Y3A4 280 aaKnown RBP14.66□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ATXN8OSP0DMR3 200 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 HCLS1P14317 486 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MYL6BP14649 208 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRKG1Q13976 671 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PPP1R42Q7Z4L9 355 aa14.65□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 COL25A1Q9BXS0 654 aaPredicted RBP14.65□□□□□ -0.06
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NUP98P52948 1817 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GRAPQ13588 217 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SLC10A5Q5PT55 438 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MCM10Q7L590 875 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DPF3Q92784 378 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 EFCC1Q9HA90 598 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 POLLQ9UGP5 575 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF609O15014 1411 aa14.64□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 C6orf229H3BNL8 230 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 VIL1P09327 827 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TAF7Q15545 349 aaPredicted RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IFNL1Q8IU54 200 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ERO1AQ96HE7 468 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PRO3102Q9H379 93 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MIS18AQ9NYP9 233 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NSFL1CQ9UNZ2 370 aaKnown RBP14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LAMA3Q16787 3333 aa14.63□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 KDM3BQ7LBC6 1761 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 IGF2BP3O00425 579 aaKnown RBP eCLIP14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ALDH1A1P00352 501 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TCIRG1Q13488 830 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DCTN1Q14203 1278 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SPRYD7Q5W111 196 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PNISRQ8TF01 805 aaKnown RBP14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ZNF428Q96B54 188 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 FZD1Q9UP38 647 aa14.62□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 DLG5Q8TDM6 1919 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GPSM2P81274 684 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CNGB1Q14028 1251 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.61□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 UNC80Q8N2C7 3258 aa14.61□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SLC9C1Q4G0N8 1177 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PARP10Q53GL7 1025 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MYOZ2Q9NPC6 264 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PTCH2Q9Y6C5 1203 aa14.6□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TAF1P21675 1872 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NEFMP07197 916 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CRHR2Q13324 411 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NBPF9Q3BBW0 867 aa14.59□□□□□ -0.07
HOXA-AS2-209ENST00000523364 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 CELF1Q92879 486 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PNNQ9H307 717 aaKnown RBP14.58□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SCN9AQ15858 1988 aa14.58□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 MANSC4A6NHS7 340 aaPredicted RBP14.57□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NF2P35240 595 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SP3Q02447 781 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 ARMC9Q7Z3E5 817 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 NBPF11Q86T75 865 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SH3TC2Q8TF17 1288 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 PLEKHF1Q96S99 279 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 LAMB2P55268 1798 aa14.57□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 COL4A1P02462 1669 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 USP17L8P0C7I0 530 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 Q7L0L9 218 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 AGBL3Q8NEM8 1001 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 TBC1D16Q8TBP0 767 aa14.56□□□□□ -0.08
HOXA-AS2-209ENST00000523364 SHISA4Q96DD7 197 aa14.56□□□□□ -0.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 29.5 ms