RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516635.1

RNU6-344P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 344, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-344P, Length 111 nt, Biotype snRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-344P-201ENST00000516635 TMC1Q8TDI8 760 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 NUDT8Q8WV74 236 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 RRAGCQ9HB90 399 aa4.01□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 FNDC3AQ9Y2H6 1198 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 EREGO14944 169 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 NDUFB5O43674 189 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 TNFRSF21O75509 655 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PCSK2P16519 638 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PERM1Q5SV97 790 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 XKR5Q6UX68 686 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 ADAMTSL4Q6UY14 1074 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 SND1Q7KZF4 910 aaKnown RBP eCLIP4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM35AQ86V20 835 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 OR13H1Q8NG92 308 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRPM4Q8TD43 1214 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM129BQ96TA1 746 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 NIF3L1Q9GZT8 377 aa4□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 M0R082 166 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSAPP07602 524 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 DGKGP49619 791 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 MARSP56192 900 aaKnown RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 SIK1P57059 783 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 GPLD1P80108 840 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 ATP11AP98196 1134 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PSAPL1Q6NUJ1 521 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 LINC00114Q6XXX2 140 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 C20orf204Q6ZNR8 217 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 MICALL1Q8N3F8 863 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 TTC16Q8NEE8 873 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF417Q8TAU3 575 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 HHIPQ96QV1 700 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZNF587Q96SQ5 575 aaPredicted RBP3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 SETDB2Q96T68 719 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 LPIN3Q9BQK8 851 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 C11orf16Q9NQ32 467 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 LATS2Q9NRM7 1088 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 DCTN4Q9UJW0 460 aa3.99□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PATL2C9JE40 543 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHACTR2O75167 634 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 ALAS2P22557 587 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 CES1P23141 567 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 USP5P45974 858 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 NRLP54845 237 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 GRIK5Q16478 980 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 RBCK1Q9BYM8 510 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 SUV39H2Q9H5I1 410 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 EFCC1Q9HA90 598 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZFYVE28Q9HCC9 887 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 JPH1Q9HDC5 661 aaPredicted RBP3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 ENAMQ9NRM1 1142 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 LRRC4BQ9NT99 713 aa3.98□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PHF20L1A8MW92 1017 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 IRS1P35568 1242 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 SOX18P35713 384 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 AFF1P51825 1210 aaKnown RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 DSC3Q14574 896 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 ELMSAN1Q6PJG2 1045 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PI16Q6UXB8 463 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 NCAPG2Q86XI2 1143 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 CEP120Q8N960 986 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 SNX29Q8TEQ0 813 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 PLD4Q96BZ4 506 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM11Q96F44 468 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 RASSF4Q9H2L5 321 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 SALL4Q9UJQ4 1053 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 TRIM33Q9UPN9 1127 aa3.97□□□□□ -1.77
RNU6-344P-201ENST00000516635 FAM229AH3BQW9 127 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 EIF1AYO14602 144 aaKnown RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 TREHO43280 583 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 RGS9O75916 674 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 KIF4AO95239 1232 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 GHRHP01286 108 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 EHHADHQ08426 723 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 HYAL2Q12891 473 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 PDE3BQ13370 1112 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 DNAJC14Q6Y2X3 702 aaPredicted RBP3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 ASB16Q96NS5 453 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 CITED4Q96RK1 184 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 LACRTQ9GZZ8 138 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 RNF19AQ9NV58 838 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 WWC3Q9ULE0 1092 aa3.96□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 ZBTB7CA1YPR0 619 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 ANKRD33BA6NCL7 494 aa3.95□□□□□ -1.78
RNU6-344P-201ENST00000516635 METTL12A8MUP2 240 aa3.95□□□□□ -1.78
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 58.3 ms