RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000516228.1

RNU6-162P-201, Transcript of RNA, U6 small nuclear 162, pseudogene, humanhuman

BASIC

Gene RNU6-162P, Length 103 nt, Biotype snRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNU6-162P-201ENST00000516228 TMEM229AB2RXF0 380 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 EIF2AK2P19525 551 aaKnown RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 OXLD1Q5BKU9 147 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 DUSP27Q5VZP5 1158 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZSWIM9Q86XI8 627 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 PHTF2Q8N3S3 785 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 BCL7CQ8WUZ0 217 aaPredicted RBP2.75□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 PLD4Q96BZ4 506 aa2.75□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 C20orf173Q96LM9 149 aa2.75□□□□□ -1.97
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RNU6-162P-201ENST00000516228 FUT4P22083 530 aa2.74□□□□□ -1.97
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RNU6-162P-201ENST00000516228 FDX2Q6P4F2 183 aa2.74□□□□□ -1.97
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RNU6-162P-201ENST00000516228 KIAA1211Q6ZU35 1233 aa2.74□□□□□ -1.97
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RNU6-162P-201ENST00000516228 FLAD1Q8NFF5 587 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 CXorf38Q8TB03 319 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 PARD6AQ9NPB6 346 aa2.74□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 APBB1O00213 710 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 WISP1O95388 367 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZXDCQ2QGD7 858 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP2.73□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 DHX30Q7L2E3 1194 aaKnown RBP eCLIP2.73□□□□□ -1.97
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RNU6-162P-201ENST00000516228 HSH2DQ96JZ2 352 aa2.73□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM95CA0A1B0GW59 222 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 MEGF11A6BM72 1044 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 OVOL3O00110 214 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP2.72□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 RXRBP28702 533 aa2.72□□□□□ -1.97
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RNU6-162P-201ENST00000516228 KCNMB1Q16558 191 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZAR1Q86SH2 424 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC9A9Q8IVB4 645 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 GALNT11Q8NCW6 608 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 PI4K2BQ8TCG2 481 aa2.72□□□□□ -1.97
RNU6-162P-201ENST00000516228 CRELD1Q96HD1 420 aa2.72□□□□□ -1.97
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RNU6-162P-201ENST00000516228 FBXO15Q8NCQ5 510 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
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RNU6-162P-201ENST00000516228 ZNF503-AS2A6NEH8 195 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 FAM177BA6PVY3 158 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 NPIPB6E9PJ23 425 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 SOX18P35713 384 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 EPHA4P54764 986 aa2.7□□□□□ -1.98
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RNU6-162P-201ENST00000516228 TBC1D32Q96NH3 1257 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 ZCCHC4Q9H5U6 513 aa2.7□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 MBNL3Q9NUK0 354 aaKnown RBP2.7□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 RTEL1Q9NZ71 1219 aa2.7□□□□□ -1.98
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RNU6-162P-201ENST00000516228 LINC01387J3KSC0 135 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 FSCN2O14926 492 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 LZTS3O60299 673 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 PSAPP07602 524 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 CELA3BP08861 270 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 MED14OSP0DP75 135 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 RGS19P49795 217 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 TSGA10IPQ3SY00 556 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 SLC23A3Q6PIS1 610 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 SPRED2Q7Z698 418 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 RUSC1Q9BVN2 902 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 CD320Q9NPF0 282 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 VAV3Q9UKW4 847 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 NDUFB9Q9Y6M9 179 aa2.69□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 NUAK1O60285 661 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 EGFRP00533 1210 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 KRT1P04264 644 aa2.68□□□□□ -1.98
RNU6-162P-201ENST00000516228 CDC27P30260 824 aa2.68□□□□□ -1.98
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