RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000515737.5

SH3BP2-228, Transcript of SH3 domain binding protein 2, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP2, Length 2,579 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP2-228ENST00000515737 LSG1Q9H089 658 aaKnown RBP20.44■□□□□ 0.86
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SH3BP2-228ENST00000515737 CCDC158Q5M9N0 1113 aa20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-228ENST00000515737 DDX46Q7L014 1031 aaKnown RBP20.43■□□□□ 0.86
SH3BP2-228ENST00000515737 MPHOSPH8Q99549 860 aa20.43■□□□□ 0.86
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SH3BP2-228ENST00000515737 VGLL2Q8N8G2 317 aa20.42■□□□□ 0.86
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SH3BP2-228ENST00000515737 RTL9Q8NET4 1388 aa20.41■□□□□ 0.86
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SH3BP2-228ENST00000515737 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP20.31■□□□□ 0.84
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