RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514813.6

RRN3P1-201, Transcript of RRN3 homolog, RNA polymerase I transcription factor pseudogene 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene RRN3P1, Length 3,645 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1-201ENST00000514813 CCDC102AQ96A19 550 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3P1-201ENST00000514813 GREM2Q9H772 168 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3P1-201ENST00000514813 GRM8O00222 908 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3P1-201ENST00000514813 ITGA6P23229 1130 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3P1-201ENST00000514813 AOC3Q16853 763 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3P1-201ENST00000514813 SERPINA10Q9UK55 444 aa8.15□□□□□ -1.1
RRN3P1-201ENST00000514813 NTSR2O95665 410 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 HMGB1P09429 215 aaKnown RBP8.15□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 NBPF7P0C2Y1 421 aaPredicted RBP8.15□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 WASHC4Q2M389 1173 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 RRAGCQ9HB90 399 aa8.15□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 DDNO94850 711 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 IGKV5-2P06315 115 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 LMOD1P29536 600 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 RARSP54136 660 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 METTL24Q5JXM2 366 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 NHSQ6T4R5 1651 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 LMNB1P20700 586 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 NMRK2Q9NPI5 230 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCC12Q96J65 1359 aa8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ZNF784Q8NCA9 323 aaPredicted RBP8.14□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 KIF16BQ96L93 1317 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 SRGAP3O43295 1099 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 DZIP1LQ8IYY4 767 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 LRRFIP2Q9Y608 721 aaKnown RBP8.13□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 C4BP0C0L5 1744 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ITGB4P16144 1822 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 RTKN2Q8IZC4 609 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 GGA1Q9UJY5 639 aa8.13□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 BBOX1O75936 387 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 PCCAP05165 728 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 CTSWP56202 376 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 SOGA3Q5TF21 947 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 CARNS1A5YM72 827 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 GRAPQ13588 217 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ATF7IPQ6VMQ6 1270 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 GRAPLQ8TC17 118 aaPredicted RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 MEIS3Q99687 375 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ISCA1Q9BUE6 129 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 SBF2Q86WG5 1849 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCC4O15439 1325 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ZBED9Q6R2W3 1325 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 NEFLP07196 543 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 CCT4P50991 539 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 TMEM57Q8N5G2 664 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 DDX27Q96GQ7 796 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 BICC1Q9H694 974 aaKnown RBP8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 RNF123Q5XPI4 1314 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 KDM2BQ8NHM5 1336 aa8.12□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 USP54Q70EL1 1684 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 MRC1P22897 1456 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 G3BP1Q13283 466 aaKnown RBP eCLIP8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 STYK1Q6J9G0 422 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 HDAC5Q9UQL6 1122 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 MYH14Q7Z406 1995 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 PLEKHG2Q9H7P9 1386 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 SURF6O75683 361 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 TRIM27P14373 513 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 SUCLG2Q96I99 432 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 SCAF8Q9UPN6 1271 aaKnown RBP8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 PDZRN3Q9UPQ7 1066 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 MNX1P50219 401 aaPredicted RBP8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 EYA3Q99504 573 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 CEP126Q9P2H0 1117 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 TOGARAM1Q9Y4F4 1720 aa8.11□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 KCPQ6ZWJ8 1503 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 KCNA3P22001 575 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 IARSP41252 1262 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 PRKG1Q13976 671 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 BEND3Q5T5X7 828 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 TTLL11Q8NHH1 800 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 GNAI3P08754 354 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ABCF2Q9UG63 623 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ALDH1L2Q3SY69 923 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 OGFOD1Q8N543 542 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 PUS3Q9BZE2 481 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 PKD1L3Q7Z443 1732 aa8.1□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 NFKBIEO00221 500 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 GNAI2P04899 355 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 GPSM2P81274 684 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 EPHA10Q5JZY3 1008 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 KIAA0825Q8IV33 1275 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 SUPT20HQ8NEM7 779 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 PCMTD1Q96MG8 357 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ALDH1L1O75891 902 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 GTF2IP78347 998 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ATP6V0A2Q9Y487 856 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 PTPRCP08575 1304 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 ADCY9O60503 1353 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 H7C1D1 291 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 MS4A1P11836 297 aa8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 VEGFAP15692 232 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP8.09□□□□□ -1.11
RRN3P1-201ENST00000514813 CRAMP1Q96RY5 1269 aa8.09□□□□□ -1.11
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 12.5 ms