RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514415.1

HOXC10-204, Transcript of homeobox C10, humanhuman

TSL 3

Gene HOXC10, Length 550 nt, Biotype processed transcript.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC10-204ENST00000514415 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP14.61□□□□□ -0.07
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HOXC10-204ENST00000514415 GIGYF2Q6Y7W6 1299 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC10-204ENST00000514415 RNF214Q8ND24 703 aa14.52□□□□□ -0.09
HOXC10-204ENST00000514415 LEO1Q8WVC0 666 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC10-204ENST00000514415 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP14.52□□□□□ -0.09
HOXC10-204ENST00000514415 MYO5AQ9Y4I1 1855 aaKnown RBP14.52□□□□□ -0.09
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HOXC10-204ENST00000514415 MAST3O60307 1309 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC10-204ENST00000514415 CTAGE5O15320 804 aa14.51□□□□□ -0.09
HOXC10-204ENST00000514415 PTMAP06454 111 aaKnown RBP14.51□□□□□ -0.09
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