RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000514231.1

PDE4D-221, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 3

Gene PDE4D, Length 733 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-221ENST00000514231 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 EDEM1Q92611 657 aa10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 RBSNQ9H1K0 784 aa10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP10.24□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 APBA3O96018 575 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 CHRNA4P43681 627 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 MTMR3Q13615 1198 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 ELP3Q9H9T3 547 aa10.23□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 FAM229AH3BQW9 127 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 PDGFAP04085 211 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 RAC1P63000 192 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 PLD4Q96BZ4 506 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 NACC1Q96RE7 527 aa10.22□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 HYAL2Q12891 473 aa10.21□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 DTWD1Q8N5C7 304 aa10.21□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 TTC16Q8NEE8 873 aa10.21□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 GGNBP2Q9H3C7 697 aa10.21□□□□□ -0.77
PDE4D-221ENST00000514231 ABL1P00519 1130 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 ELNP15502 786 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 GRIK4Q16099 956 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF438Q7Z4V0 828 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 WFDC8Q8IUA0 241 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 RETREG2Q8NC44 543 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 EGFL7Q9UHF1 273 aa10.2□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 KIF4AO95239 1232 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 AAMPQ13685 434 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 SPACA7Q96KW9 195 aa10.19□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 C9orf172C9J069 976 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 USP5P45974 858 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 BAG6P46379 1132 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 SUZ12Q15022 739 aaKnown RBP10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 C8orf34Q49A92 452 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 POLIQ9UNA4 740 aa10.18□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 GATA4P43694 442 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 PMEPA1Q969W9 287 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 ANO2Q9NQ90 1003 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 CNTN3Q9P232 1028 aa10.17□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 ICMTO60725 284 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 EHHADHQ08426 723 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 FBXO11Q86XK2 927 aa10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP10.16□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 FZD6O60353 706 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 SELPP16109 830 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 IL22RA1Q8N6P7 574 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 CEP120Q8N960 986 aa10.15□□□□□ -0.78
PDE4D-221ENST00000514231 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 TXNDC2Q86VQ3 553 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 NCAPG2Q86XI2 1143 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 C1orf127Q8N9H9 656 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 SALL4Q9UJQ4 1053 aa10.14□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 A6NHS1 94 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 CES1P23141 567 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 ECM1Q16610 540 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 MUC3BQ9H195 1237 aa10.13□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 SERPINB4P48594 390 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 ADGRE1Q14246 886 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 CEP135Q66GS9 1140 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 PBX4Q9BYU1 374 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 CCDC87Q9NVE4 849 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 TRIM33Q9UPN9 1127 aa10.12□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 ATP11AP98196 1134 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 IGF2-ASQ6U949 168 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 SHISA2Q6UWI4 295 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 GJD3Q8N144 294 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 RASSF4Q9H2L5 321 aa10.11□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 TNFRSF21O75509 655 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 MAP4K3Q8IVH8 894 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 GLYCTKQ8IVS8 523 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 CHRDQ9H2X0 955 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 KANSL3Q9P2N6 904 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 PPME1Q9Y570 386 aa10.1□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 H3BRB1 525 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 ADAM23O75077 832 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 DOC2BQ14184 412 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 MBTPS1Q14703 1052 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 DCAF11Q8TEB1 546 aa10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
PDE4D-221ENST00000514231 DLL1O00548 723 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 FURINP09958 794 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 POP1Q99575 1024 aaKnown RBP10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 USP21Q9UK80 565 aa10.08□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 PHACTR2O75167 634 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 CDC27P30260 824 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 SETDB1Q15047 1291 aa10.07□□□□□ -0.8
PDE4D-221ENST00000514231 TXNRD3Q86VQ6 643 aa10.07□□□□□ -0.8
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 154.3 ms