RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000504994.1

HERC3-209, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 5

Gene HERC3, Length 341 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-209ENST00000504994 EHD4Q9H223 541 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 KANSL3Q9P2N6 904 aa7.15□□□□□ -1.26
HERC3-209ENST00000504994 SPINT1O43278 529 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 KLF4O43474 513 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 EGFRP00533 1210 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 EPB42P16452 691 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 CES1P23141 567 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 MAP3K11Q16584 847 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 ARSJQ5FYB0 599 aaPredicted RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 NLRP13Q86W25 1043 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 RELL1Q8IUW5 271 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 RNPC3Q96LT9 517 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 SRPK1Q96SB4 655 aaKnown RBP7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 ABCB6Q9NP58 842 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 SNTG2Q9NY99 539 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 HCSTQ9UBK5 93 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 TRAK1Q9UPV9 953 aa7.14□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 GARTP22102 1010 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 FAM160A1Q05DH4 1040 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 MMRN1Q13201 1228 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 RAB33AQ14088 237 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 RASA3Q14644 834 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 FBXL19Q6PCT2 694 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 MICAL1Q8TDZ2 1067 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 TRIM55Q9BYV6 548 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 KCNQ5Q9NR82 932 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 SIRPGQ9P1W8 387 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 STRIP2Q9ULQ0 834 aa7.13□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 hCG_2014768A0A024R1R8 64 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 A0A1W2PNR3 127 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 FAM221BA6H8Z2 402 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 MARCH6O60337 910 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 MSX1P28360 303 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 TTC39BQ5VTQ0 682 aaPredicted RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 PHC3Q8NDX5 983 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 RNF217Q8TC41 542 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 ANKRD24Q8TF21 1146 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 PMEPA1Q969W9 287 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 CEP63Q96MT8 703 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 TSEN34Q9BSV6 310 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 NT5C1AQ9BXI3 368 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 PPM1HQ9ULR3 514 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 TLR6Q9Y2C9 796 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 AKAP2Q9Y2D5 859 aa7.12□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 CELA3AP09093 270 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 IGBP1P78318 339 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 TPTE2Q6XPS3 522 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 LINC00528Q8N1L1 170 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 DEPDC7Q96QD5 511 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 UBP1Q9NZI7 540 aa7.11□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 A0A1B0GTH6 734 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 GREM1O60565 184 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 CLSTN1O94985 981 aa7.1□□□□□ -1.27
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HERC3-209ENST00000504994 EDN3P14138 238 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 LIG3P49916 1009 aa7.1□□□□□ -1.27
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HERC3-209ENST00000504994 CCDC81Q6ZN84 652 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 SV2BQ7L1I2 683 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 ZNF598Q86UK7 904 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 ANAPC16Q96DE5 110 aa7.1□□□□□ -1.27
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HERC3-209ENST00000504994 TCF12Q99081 682 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 CNTNAP3Q9BZ76 1288 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 KANSL2Q9H9L4 492 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 LIN7BQ9HAP6 207 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 BRD7Q9NPI1 651 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 PPP4R2Q9NY27 417 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 PRKAG3Q9UGI9 489 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.1□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 SUPT16HQ9Y5B9 1047 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
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HERC3-209ENST00000504994 U2SURPO15042 1029 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 ACPPP15309 386 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 RHOQP17081 205 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 SMPD1P17405 629 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 CRKP46108 304 aa7.09□□□□□ -1.27
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HERC3-209ENST00000504994 WDR44Q5JSH3 913 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 RNF187Q5TA31 235 aaPredicted RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 FILIP1Q7Z7B0 1213 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 SHDQ96IW2 340 aa7.09□□□□□ -1.27
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HERC3-209ENST00000504994 ZCCHC2Q9C0B9 1178 aaKnown RBP7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 TIMMDC1Q9NPL8 285 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 KLHL42Q9P2K6 505 aa7.09□□□□□ -1.27
HERC3-209ENST00000504994 COL4A3BPQ9Y5P4 624 aa7.09□□□□□ -1.27
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HERC3-209ENST00000504994 SASH3O75995 380 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 RLBP1P12271 317 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 APOBRQ0VD83 1088 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 SNAP47Q5SQN1 464 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 KRT25Q7Z3Z0 450 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 GOLM1Q8NBJ4 401 aa7.08□□□□□ -1.28
HERC3-209ENST00000504994 OR13H1Q8NG92 308 aa7.08□□□□□ -1.28
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