RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000499038.2

UBE2B-202, Transcript of ubiquitin conjugating enzyme E2 B, humanhuman

TSL 3

Gene UBE2B, Length 682 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2B-202ENST00000499038 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
UBE2B-202ENST00000499038 ZBTB39O15060 712 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-202ENST00000499038 TXNRD3Q86VQ6 643 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-202ENST00000499038 FBXO11Q86XK2 927 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-202ENST00000499038 SPACA7Q96KW9 195 aa8.47□□□□□ -1.05
UBE2B-202ENST00000499038 HYAL2Q12891 473 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 RSPO4Q2I0M5 234 aaPredicted RBP8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 ILDR2Q71H61 639 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 OR13H1Q8NG92 308 aa8.46□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 SCNN1AP37088 669 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 IL22RA1Q8N6P7 574 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 HELQQ8TDG4 1101 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 C1orf115Q9H7X2 142 aa8.45□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 ATCAYQ86WG3 371 aa8.44□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 NUDT16Q96DE0 195 aaKnown RBP8.44□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP8.44□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 RPLP1P05386 114 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 PCSK2P16519 638 aa8.43□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 NKAPLQ5M9Q1 402 aa8.43□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 TTC16Q8NEE8 873 aa8.43□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 TRIM33Q9UPN9 1127 aa8.43□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM88BA6NKF7 163 aa8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 DYRK3O43781 588 aa8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 PDE12Q6L8Q7 609 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 IGF2-ASQ6U949 168 aa8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 ZNF438Q7Z4V0 828 aa8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 EDEM1Q92611 657 aa8.42□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 SSFA2P28290 1259 aa8.41□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa8.41□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 GTF3C2Q8WUA4 911 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 TP53INP1Q96A56 240 aa8.41□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 ELP3Q9H9T3 547 aa8.41□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 MTMR7Q9Y216 660 aa8.41□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 MPSTP25325 297 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 ATP11AP98196 1134 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 C8orf34Q49A92 452 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 CEP135Q66GS9 1140 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 MAP4K3Q8IVH8 894 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 DCAF11Q8TEB1 546 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 WFDC12Q8WWY7 111 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 LACRTQ9GZZ8 138 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 MUC3BQ9H195 1237 aa8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 SRA1Q9HD15 236 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.06
UBE2B-202ENST00000499038 FAM177BA6PVY3 158 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 DLL1O00548 723 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 ITGB7P26010 798 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 IREB2P48200 963 aaKnown RBP8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 AAMPQ13685 434 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 ALKBH2Q6NS38 261 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 RASSF4Q9H2L5 321 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 TMEM63CQ9P1W3 806 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 PPME1Q9Y570 386 aa8.39□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 KIF4AO95239 1232 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 PDGFAP04085 211 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 H2AFB1P0C5Y9 115 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 H2AFB2P0C5Z0 115 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 NOS3P29474 1203 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 EIF1AXP47813 144 aaKnown RBP8.38□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 MTMR3Q13615 1198 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.38□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 MZF1P28698 734 aaPredicted RBP8.37□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 CDC27P30260 824 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 Q8N3U1 123 aa8.37□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 MRPL18Q9H0U6 180 aaKnown RBP8.37□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 LINC01387J3KSC0 135 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 SETDB1Q15047 1291 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 PRSS36Q5K4E3 855 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 PBX4Q9BYU1 374 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 AKTIPQ9H8T0 292 aa8.36□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 CARNS1A5YM72 827 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 A6NHS1 94 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 FAM13AO94988 1023 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 ABL1P00519 1130 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 CES1P23141 567 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 CDC25BP30305 580 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 FAM117BQ6P1L5 589 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 TXNDC11Q6PKC3 985 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 SSBP4Q9BWG4 385 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 GGNBP2Q9H3C7 697 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 CNTN3Q9P232 1028 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 POLIQ9UNA4 740 aa8.35□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 SCO2A0A1W2PP80 73 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 PTPRAP18433 802 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 XKR5Q6UX68 686 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 CEP120Q8N960 986 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 C1orf127Q8N9H9 656 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 MEGF10Q96KG7 1140 aa8.34□□□□□ -1.07
UBE2B-202ENST00000499038 ALX3O95076 343 aa8.33□□□□□ -1.08
UBE2B-202ENST00000499038 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 26.4 ms