RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000492966.5

TMBIM1-222, Transcript of transmembrane BAX inhibitor motif containing 1, human

TSL 4

Gene TMBIM1, Length 400 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
TMBIM1-222	ENST00000492966	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	SP3	Q02447	781 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	TTLL12	Q14166	644 aa	Predicted RBP	10.14	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	TESK2	Q96S53	571 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	VPS33B	Q9H267	617 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		10.14	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZDBF2	Q9HCK1	2354 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	EVI5	O60447	810 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	BMP8B	P34820	402 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	CLEC4G	Q6UXB4	293 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	MAFA	Q8NHW3	353 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	CRAMP1	Q96RY5	1269 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	DBNDD1	Q9H9R9	158 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZBTB4	Q9P1Z0	1013 aa	Predicted RBP	10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	FZD1	Q9UP38	647 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	ATP6V0A2	Q9Y487	856 aa		10.13	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	TCF20	Q9UGU0	1960 aa	Known RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	GTF2E1	P29083	439 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	PRKG1	Q13976	671 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	SCARF1	Q14162	830 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	HLF	Q16534	295 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	DPP8	Q6V1X1	898 aa	Predicted RBP	10.12	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	CARD14	Q9BXL6	1004 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	CARD11	Q9BXL7	1154 aa		10.12	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	MYO9B	Q13459	2157 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	REV3L	O60673	3130 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	FARP2	O94887	1054 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	TDH	Q8IZJ6	230 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	SUPT20H	Q8NEM7	779 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	SYMPK	Q92797	1274 aa	Known RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	ARHGAP39	Q9C0H5	1083 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZMYND8	Q9ULU4	1186 aa	Predicted RBP	10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZNF652	Q9Y2D9	606 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		10.11	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	ABCC4	O15439	1325 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	COL4A1	P02462	1669 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	MANSC4	A6NHS7	340 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	POTEB2	H3BUK9	544 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	NPM2	Q86SE8	214 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	ALYREF	Q86V81	257 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	TTC5	Q8N0Z6	440 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	RBM17	Q96I25	401 aa	Known RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	CFAP54	Q96N23	3096 aa		10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	COL2A1	P02458	1487 aa	Predicted RBP	10.1	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	MGAM	O43451	1857 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	GJA8	P48165	433 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	TCIRG1	Q13488	830 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	SULT6B1	Q6IMI4	303 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	PTPN18	Q99952	460 aa		10.09	□□□□□ -0.79
TMBIM1-222	ENST00000492966	SYN1	P17600	705 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	RPS12	P25398	132 aa	Known RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	MAGEA10	P43363	369 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	CLMN	Q96JQ2	1002 aa		10.08	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	CDX2	Q99626	313 aa	Predicted RBP	10.08	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	UBN2	Q6ZU65	1347 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	CACNA1B	Q00975	2339 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	GJA5	P36382	358 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	TJAP1	Q5JTD0	557 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	LDLRAD1	Q5T700	205 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	C7orf61	Q8IZ16	206 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	WNK4	Q96J92	1243 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	USP16	Q9Y5T5	823 aa		10.07	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	NBPF26	B4DH59	902 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	KCNQ3	O43525	872 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	GJB1	P08034	283 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	CCL5	P13501	91 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	DOK7	Q18PE1	504 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	NBPF10	Q6P3W6	841 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZNF790	Q6PG37	636 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	USP38	Q8NB14	1042 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	MYLIP	Q8WY64	445 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	TEX13A	Q9BXU3	409 aa	Predicted RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	USP34	Q70CQ2	3546 aa		10.06	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	RIMBP2	O15034	1052 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	ECE2	O60344	883 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	GPT	P24298	496 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZNF280A	P59817	542 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	FAM109B	Q6ICB4	259 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	NKX2-3	Q8TAU0	364 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	U2AF1L4	Q8WU68	220 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	TMX4	Q9H1E5	349 aa	Predicted RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	ANGEL1	Q9UNK9	670 aa	Known RBP	10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	ECM29	Q5VYK3	1845 aa		10.05	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	DOCK3	Q8IZD9	2030 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	INHBE	P58166	350 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	NBPF9	Q3BBW0	867 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	SP8	Q8IXZ3	490 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	UBE2O	Q9C0C9	1292 aa	Known RBP	10.04	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	NYX	Q9GZU5	481 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	RNF208	Q9H0X6	261 aa		10.04	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	IBTK	Q9P2D0	1353 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	RGL2	O15211	777 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	NTSR2	O95665	410 aa		10.03	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	VIL1	P09327	827 aa	Known RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	ZBTB48	P10074	688 aa	Predicted RBP	10.03	□□□□□ -0.8
TMBIM1-222	ENST00000492966	CTGF	P29279	349 aa		10.03	□□□□□ -0.8

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