RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000489160.1

CCL20-204, Transcript of C-C motif chemokine ligand 20, humanhuman

TSL 3

Gene CCL20, Length 673 nt, Biotype retained intron.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL20-204ENST00000489160 FAM181BA6NEQ2 426 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 NEURL1BA8MQ27 555 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 OIP5O43482 229 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 PSAPP07602 524 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 SOX18P35713 384 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 ITGAEP38570 1179 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 XPCQ01831 940 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 USPL1Q5W0Q7 1092 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP8.33□□□□□ -1.08
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CCL20-204ENST00000489160 CCDC74AQ96AQ1 378 aa8.33□□□□□ -1.08
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CCL20-204ENST00000489160 DUSP9Q99956 384 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 PARP2Q9UGN5 583 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 KLF15Q9UIH9 416 aa8.33□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 PHF20L1A8MW92 1017 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 EREGO14944 169 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 HOXD8P13378 290 aaPredicted RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 PCBP4P57723 403 aaKnown RBP8.32□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 FRMD6Q96NE9 622 aa8.32□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP8.31□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 GNA15P30679 374 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 PLAURQ03405 335 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 GALNT12Q8IXK2 581 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 GALNT6Q8NCL4 622 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 EDARADDQ8WWZ3 215 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF25Q93038 417 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 NLRP2Q9NX02 1062 aa8.31□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 ARHGEF15O94989 841 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 POLR3DP05423 398 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 EPXP11678 715 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 EDN3P14138 238 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 VAMP1P23763 118 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 DAB2P98082 770 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 HYAL2Q12891 473 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 TMC4Q7Z404 712 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 FCHSD1Q86WN1 690 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 KIAA1522Q9P206 1035 aaPredicted RBP8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 KANSL3Q9P2N6 904 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 SPG7Q9UQ90 795 aa8.3□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 ELOA3CA0A087WX78 387 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 ELOA3DA6NLF2 546 aaPredicted RBP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 ADARB2-AS1A8MUL3 147 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 NRLP54845 237 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 PSMD2Q13200 908 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 PCSK7Q16549 785 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 ELOA3BQ3SY89 546 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 LARP7Q4G0J3 582 aaKnown RBP eCLIP8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 ELOA3Q8NG57 546 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 TRPM4Q8TD43 1214 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 MRS2Q9HD23 443 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 NPHS2Q9NP85 383 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 SALL4Q9UJQ4 1053 aa8.29□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 GIPC1O14908 333 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 KIF4AO95239 1232 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 ALAS2P22557 587 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 GPLD1P80108 840 aa8.28□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 C1orf229Q6ZS94 237 aaPredicted RBP8.28□□□□□ -1.08
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CCL20-204ENST00000489160 EPS8L3Q8TE67 593 aaKnown RBP8.28□□□□□ -1.08
CCL20-204ENST00000489160 SORBS3O60504 671 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 IRS1P35568 1242 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 MRPL58Q14197 206 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 NCAPG2Q86XI2 1143 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 FAM161BQ96MY7 647 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 MDFIQ99750 246 aa8.27□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 UBE2OQ9C0C9 1292 aaKnown RBP8.27□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 RNF19AQ9NV58 838 aa8.27□□□□□ -1.09
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CCL20-204ENST00000489160 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 KIAA0319Q5VV43 1072 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 PI16Q6UXB8 463 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 BTBD6Q96KE9 485 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 SPACA7Q96KW9 195 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 NSUN5Q96P11 429 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 IGFLR1Q9H665 355 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 DNAJB12Q9NXW2 375 aaKnown RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 ADAMTS8Q9UP79 889 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 AK5Q9Y6K8 562 aa8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP8.26□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 SHISA8B8ZZ34 492 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 ADH7P40394 386 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 TBC1D8BQ0IIM8 1120 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 SRCIN1Q9C0H9 1055 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 SUV39H2Q9H5I1 410 aa8.25□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 LOC102724428A0A0B4J2F2 783 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 A0A1W2PP55 124 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 ZBTB42B2RXF5 422 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 AMPD1P23109 780 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 EIF4BP23588 611 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 SIK1P57059 783 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 PEAR1Q5VY43 1037 aaPredicted RBP8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 CEP120Q8N960 986 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 C12orf49Q9H741 205 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 LATS2Q9NRM7 1088 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 VTI1BQ9UEU0 232 aa8.24□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 MLLT1Q03111 559 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CCL20-204ENST00000489160 KANK3Q6NY19 840 aa8.23□□□□□ -1.09
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