RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000482333.5

USP13-202, Transcript of ubiquitin specific peptidase 13, humanhuman

TSL 5

Gene USP13, Length 1,966 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP13-202ENST00000482333 BCL2L12Q9HB09 334 aa26.23■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 CIZ1Q9ULV3 898 aaPredicted RBP26.23■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 KCNB2Q92953 911 aa26.22■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 GNPATO15228 680 aa26.22■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 NECTIN1Q15223 517 aa26.22■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 GORABQ5T7V8 394 aa26.22■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP26.22■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 CCDC158Q5M9N0 1113 aa26.21■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 SEC31BQ9NQW1 1179 aa26.21■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP26.21■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 SPEF2Q9C093 1822 aa26.21■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 TTC39AQ5SRH9 613 aa26.2■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 AMIGO3Q86WK7 504 aa26.2■■□□□ 1.79
USP13-202ENST00000482333 MCM2P49736 904 aa26.2■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 SRP68Q9UHB9 627 aaKnown RBP26.2■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 NARFQ9UHQ1 456 aa26.2■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 EP400Q96L91 3159 aa26.19■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 RGL2O15211 777 aa26.19■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 TAF5LO75529 589 aa26.19■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 PDE8BO95263 885 aa26.19■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 USPL1Q5W0Q7 1092 aa26.19■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 TMX3Q96JJ7 454 aa26.19■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 SEC62Q99442 399 aaKnown RBP26.19■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 SCARF1Q14162 830 aa26.18■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 CCDC152Q4G0S7 254 aa26.18■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 TBC1D9BQ66K14 1250 aa26.18■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 RTL9Q8NET4 1388 aa26.18■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 HSP90B1P14625 803 aaKnown RBP26.18■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 ERFEQ4G0M1 354 aa26.18■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 CREB3L3Q68CJ9 461 aa26.18■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP26.18■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 SLFNL1Q499Z3 407 aa26.17■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 BICDL1Q6ZP65 573 aa26.17■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 CCDC129Q6ZRS4 1044 aa26.17■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 MROH5Q6ZUA9 1318 aa26.17■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 KCNJ4P48050 445 aa26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 ADCK5Q3MIX3 580 aa26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 RTCBQ9Y3I0 505 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 C4BP0C0L5 1744 aa26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 ABCC12Q96J65 1359 aa26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 FKBP4Q02790 459 aaKnown RBP eCLIP26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 NOL8Q76FK4 1167 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 TICAM2Q86XR7 235 aa26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 ZGPATQ8N5A5 531 aaKnown RBP26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 TTC14Q96N46 770 aa26.16■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 BRWD3Q6RI45 1802 aa26.15■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 COL4A1P02462 1669 aa26.15■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 SLC27A2O14975 620 aa26.15■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 RAB3GAP1Q15042 981 aa26.15■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 C3orf67Q6ZVT6 689 aa26.15■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 IL27Q8NEV9 243 aa26.15■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 ARHGEF1Q92888 912 aaKnown RBP26.15■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 CASZ1Q86V15 1759 aa26.14■■□□□ 1.78
USP13-202ENST00000482333 CPA1P15085 419 aa26.14■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 CASTP20810 708 aaKnown RBP26.14■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 FGFR2P21802 821 aa26.14■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 MPHOSPH8Q99549 860 aa26.14■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 AKAP11Q9UKA4 1901 aa26.14■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 ZPR1O75312 459 aa26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 PUM3Q15397 648 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 PI16Q6UXB8 463 aa26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 LRRC4BQ9NT99 713 aa26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 ZKSCAN1P17029 563 aaPredicted RBP26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 ZAP70P43403 619 aa26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 CUL4AQ13619 759 aa26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 ZMYM1Q5SVZ6 1142 aa26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 TNPO1Q92973 898 aaKnown RBP26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 TM6SF1Q9BZW5 370 aa26.13■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 COL24A1Q17RW2 1714 aa26.12■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 ARAP2Q8WZ64 1704 aa26.12■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 RNF113AO15541 343 aaKnown RBP26.12■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 C4AP0C0L4 1744 aa26.12■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 HELLSQ9NRZ9 838 aa26.12■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 TAF6LQ9Y6J9 622 aa26.12■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 MCAMP43121 646 aa26.11■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 ZNF512BQ96KM6 892 aaPredicted RBP26.11■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 ZSWIM6Q9HCJ5 1215 aa26.11■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 MCM4P33991 863 aa26.11■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 LPIN2Q92539 896 aa26.11■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 CWC22Q9HCG8 908 aaKnown RBP26.11■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 SSFA2P28290 1259 aa26.1■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 AK2P54819 239 aa26.1■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 SF3B3Q15393 1217 aaKnown RBP26.1■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 FAM196AQ6ZSG2 479 aa26.1■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 KRT27Q7Z3Y8 459 aa26.1■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 SETDB2Q96T68 719 aa26.1■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP26.1■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 SNAP23O00161 211 aa26.09■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 PHKA1P46020 1223 aa26.09■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 SLC10A5Q5PT55 438 aa26.09■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 CCDC102BQ68D86 513 aa26.09■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 RNF20Q5VTR2 975 aa26.09■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 TAF1P21675 1872 aa26.08■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 PHF14O94880 888 aa26.08■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 COL9A3Q14050 684 aaPredicted RBP26.08■■□□□ 1.77
USP13-202ENST00000482333 RUFY3Q7L099 469 aa26.08■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 15.9 ms