RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000464611.1

ACTB-208, Transcript of actin beta, humanhuman

TSL 5

Gene ACTB, Length 715 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cell leading edge, Cytoplasm, Cytosol, Exosome, Lamellipodium, Mitochondria, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTB-208ENST00000464611 KIF3AQ9Y496 699 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 TNS1Q9HBL0 1735 aaKnown RBP10.15□□□□□ -0.78
ACTB-208ENST00000464611 F13A1P00488 732 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 AIMP1Q12904 312 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 PROSER3Q2NL68 480 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 CREB3L3Q68CJ9 461 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 BLOC1S2Q6QNY1 142 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 PPIL4Q8WUA2 492 aaKnown RBP eCLIP10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 EAF2Q96CJ1 260 aaPredicted RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 KAZALD1Q96I82 304 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 JAKMIP1Q96N16 626 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 FSD1Q9BTV5 496 aa10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 NOL7Q9UMY1 257 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 RBM8AQ9Y5S9 174 aaKnown RBP10.14□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ELP1O95163 1332 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 BTAF1O14981 1849 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 H7C1W4 665 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ANXA1P04083 346 aa10.13□□□□□ -0.79
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ACTB-208ENST00000464611 SYT1P21579 422 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 PRIM1P49642 420 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 PRPF40BQ6NWY9 871 aaKnown RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 PDZRN4Q6ZMN7 1036 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 USP48Q86UV5 1035 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 RASEFQ8IZ41 740 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 CCDC191Q8NCU4 936 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 RGS22Q8NE09 1264 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 MYD88Q99836 296 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 TMEM63CQ9P1W3 806 aa10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 RPAP1Q9BWH6 1393 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 SLC27A2O14975 620 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ZNF500O60304 480 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 CIAO1O76071 339 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 CAVIN2O95810 425 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 MAP4K4O95819 1239 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 TPM2P07951 284 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 IL15P40933 162 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 NMIQ13287 307 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 TNNI3KQ59H18 835 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ATL3Q6DD88 541 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 LRP10Q7Z4F1 713 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ARXQ96QS3 562 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 HAUS7Q99871 368 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 LLPHQ9BRT6 129 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 SCAND2PQ9GZW5 306 aaPredicted RBP10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 RBSNQ9H1K0 784 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 HELLSQ9NRZ9 838 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 TMOD3Q9NYL9 352 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 PA2G4Q9UQ80 394 aaKnown RBP10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 MED23Q9ULK4 1368 aa10.12□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 A0A087WZG4 1122 aa10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ATMINO43313 823 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
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ACTB-208ENST00000464611 PTH1RQ03431 593 aa10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 PTPN12Q05209 780 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 TRIM28Q13263 835 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 MCMDC2Q4G0Z9 681 aa10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 LARP1BQ659C4 914 aaKnown RBP10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 CDAN1Q8IWY9 1227 aa10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 SYTL4Q96C24 671 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ZSCAN16Q9H4T2 348 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 CWC25Q9NXE8 425 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ABCC12Q96J65 1359 aa10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 LAMB4A4D0S4 1761 aa10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 UBR2Q8IWV8 1755 aa10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 CICQ96RK0 1608 aaPredicted RBP10.11□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 SYCE3A1L190 88 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 TAF5LO75529 589 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 MYL6BP14649 208 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 SLC39A6Q13433 755 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 VSIG10Q8N0Z9 540 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 KBTBD3Q8NAB2 608 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 DSCC1Q9BVC3 393 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 CCDC8Q9H0W5 538 aaPredicted RBP10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 IL25Q9H293 177 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 AKAP2Q9Y2D5 859 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 USP16Q9Y5T5 823 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 SPEF2Q9C093 1822 aa10.1□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 SH3TC1Q8TE82 1336 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ZNF831Q5JPB2 1677 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 OFD1O75665 1012 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ZFYP08048 801 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 CASP7P55210 303 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 SF3B2Q13435 895 aaKnown RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 FBXL16Q8N461 479 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 ACSBG1Q96GR2 724 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 NEK1Q96PY6 1258 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 BCL11BQ9C0K0 894 aaPredicted RBP10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 BOLA2Q9H3K6 86 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 MTMR6Q9Y217 621 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 LY75O60449 1722 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 PALLDQ8WX93 1383 aa10.09□□□□□ -0.79
ACTB-208ENST00000464611 PRAMEF22A3QJZ6 481 aa10.08□□□□□ -0.8
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