RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000461018.5

CNN3-204, Transcript of calponin 3, humanhuman

TSL 2

Gene CNN3, Length 568 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN3-204ENST00000461018 SLFNL1Q499Z3 407 aa6.71□□□□□ -1.34
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CNN3-204ENST00000461018 BEND7Q8N7W2 519 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 KDF1Q8NAX2 398 aaPredicted RBP6.71□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 SBF2Q86WG5 1849 aa6.71□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 PCNTO95613 3336 aa6.71□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 ADCY9O60503 1353 aa6.7□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa6.7□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 SEMA3FQ13275 785 aa6.7□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 PRICKLE2Q7Z3G6 844 aa6.7□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 PODNQ7Z5L7 613 aa6.7□□□□□ -1.34
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CNN3-204ENST00000461018 PEAK1Q9H792 1746 aa6.7□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 FMN2Q9NZ56 1722 aa6.7□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 ARHGEF10O15013 1369 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 KIAA0232Q92628 1395 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 PRAG1Q86YV5 1406 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 A0A1W2PRU2 124 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 RAD21O60216 631 aa6.69□□□□□ -1.34
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CNN3-204ENST00000461018 ZC3H6P61129 1189 aaKnown RBP6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 ERVK-9P63128 1117 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 ZNF827Q17R98 1081 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 TSGA10IPQ3SY00 556 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 RNF217Q8TC41 542 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 NLRP3Q96P20 1036 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 CDCA7Q9BWT1 371 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 ARHGEF10LQ9HCE6 1279 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 CNTNAP5Q8WYK1 1306 aa6.69□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 VPS8Q8N3P4 1428 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 KIF1AQ12756 1690 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 WASHC4Q2M389 1173 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 OXLD1Q5BKU9 147 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 SLC27A3Q5K4L6 730 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 TMEM132EQ6IEE7 984 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 CYP2U1Q7Z449 544 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 RNF135Q8IUD6 432 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 POM121Q96HA1 1249 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 RAB6BQ9NRW1 208 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 COG6Q9Y2V7 657 aa6.68□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 TRPM3Q9HCF6 1732 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 NRXN1Q9ULB1 1477 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 GRIN3BO60391 1043 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 GAS6Q14393 721 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 FOXD4L5Q5VV16 416 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 NUTM2GQ5VZR2 741 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 LYSMD3Q7Z3D4 306 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 WWC1Q8IX03 1113 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 TCP11L2Q8N4U5 519 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 MARCH10Q8NA82 808 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 NEDD1Q8NHV4 660 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 OSBPL3Q9H4L5 887 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 DOLKQ9UPQ8 538 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 CRYBG1Q9Y4K1 1723 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 RGPD3A6NKT7 1758 aaPredicted RBP6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 RGPD4Q7Z3J3 1758 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 TNS2Q63HR2 1409 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 SSH2Q76I76 1423 aa6.67□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 ALS2Q96Q42 1657 aa6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 K7ELQ4 463 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 PROCP04070 461 aa6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 ITGB2P05107 769 aa6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 HSPA1AP0DMV8 641 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 EVA1CP58658 441 aa6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 TMEM132AQ24JP5 1023 aa6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 FOXR1Q6PIV2 292 aa6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 GMCL1Q96IK5 515 aa6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 MBIPQ9NS73 344 aa6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 WDR90Q96KV7 1748 aa6.66□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 CLTCL1P53675 1640 aa6.65□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 PHRF1Q9P1Y6 1649 aaKnown RBP6.65□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 BCRP11274 1271 aa6.65□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 FLIIQ13045 1269 aa6.65□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 SAFB2Q14151 953 aaKnown RBP eCLIP6.65□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.65□□□□□ -1.34
CNN3-204ENST00000461018 NUP155O75694 1391 aa6.65□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 RNF144AP50876 292 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 POU4F2Q12837 409 aa6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 USP4Q13107 963 aa6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 NMRK2Q9NPI5 230 aa6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 LRRC4BQ9NT99 713 aa6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 CUEDC1Q9NWM3 386 aaPredicted RBP6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 ADGRF5Q8IZF2 1346 aa6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 OVOS2A0A0G2JMS6 1433 aa6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 OVOS2A0A0J9YW53 1432 aa6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 OVOS2Q6IE36 1432 aa6.64□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 LOC105371045A0A1W2PR82 267 aa6.63□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 TOMM70O94826 608 aa6.63□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 STAU1O95793 577 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 ATP7BP35670 1465 aa6.63□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 KCNQ4P56696 695 aa6.63□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 CLN3Q13286 438 aa6.63□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 PHTF2Q8N3S3 785 aa6.63□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 PARP4Q9UKK3 1724 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
CNN3-204ENST00000461018 COL24A1Q17RW2 1714 aa6.62□□□□□ -1.35
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