RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000460332.1

NOM1-202, Transcript of nucleolar protein with MIF4G domain 1, humanhuman

TSL 3

Gene NOM1, Length 706 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1-202ENST00000460332 LRP6O75581 1613 aa6.36□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 TMEM229AB2RXF0 380 aa6.35□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 PTMSP20962 102 aa6.35□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 AAMPQ13685 434 aa6.35□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 GRIK4Q16099 956 aa6.35□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 PLPP7Q8NBV4 271 aa6.35□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 PSMD1Q99460 953 aa6.35□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 TBC1D2BQ9UPU7 963 aa6.35□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 GTF3C5Q9Y5Q8 519 aaPredicted RBP6.35□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 USP3Q9Y6I4 520 aa6.35□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 NPHP4O75161 1426 aaPredicted RBP6.34□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 BACH1O14867 736 aa6.34□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 IGSF3O75054 1194 aa6.34□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 ALBP02768 609 aa6.34□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 NID1P14543 1247 aa6.34□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 NEUROD4Q9HD90 331 aa6.34□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 PARP3Q9Y6F1 533 aa6.34□□□□□ -1.39
NOM1-202ENST00000460332 ELNP15502 786 aa6.33□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 TXLNAP40222 546 aa6.33□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 ADH7P40394 386 aa6.33□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SETQ01105 290 aaPredicted RBP6.33□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 ADGRE1Q14246 886 aa6.33□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 LRRC69Q6ZNQ3 347 aa6.33□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 AFAP1Q8N556 730 aa6.33□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 ABCC1P33527 1531 aa6.33□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 RGS12O14924 1447 aa6.33□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 COL16A1Q07092 1604 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 PLEKHD1A6NEE1 506 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 HYAL3O43820 417 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 NCLP19338 710 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 NRG1Q02297 640 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SPEM2Q0P670 501 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 IRF5Q13568 498 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 MBTPS1Q14703 1052 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 NEUROD2Q15784 382 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 TRAPPC3LQ5T215 181 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 ZNF772Q68DY9 489 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 C8orf86Q6ZUL3 223 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 TXNRD3Q86VQ6 643 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SLC30A3Q99726 388 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SCHIP1Q9P0W5 487 aaPredicted RBP6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SHPRHQ149N8 1683 aa6.32□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 DROSHAQ9NRR4 1374 aaKnown RBP eCLIP6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 JCADQ9P266 1359 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 PLXNC1O60486 1568 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 EML1O00423 815 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 LILRB5O75023 590 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 RXRBP28702 533 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 RAC1P63000 192 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 TEAD4Q15561 434 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 C20orf204Q6ZNR8 217 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 ZDHHC1Q8WTX9 485 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 L3MBTL2Q969R5 705 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 GOLGA2P5Q9HBQ8 144 aa6.31□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 CDC42BPBQ9Y5S2 1711 aa6.3□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SFSWAPQ12872 951 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 EFCAB2Q5VUJ9 269 aa6.3□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 LENG1Q96BZ8 264 aaPredicted RBP6.3□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 PCDHGA11Q9Y5H2 935 aa6.3□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 LRRC9Q6ZRR7 1453 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 KIF14Q15058 1648 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 NHSL1Q5SYE7 1610 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 A0A0A0MRY4 1105 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SELPP16109 830 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 NOS2P35228 1153 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 VAC14Q08AM6 782 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 TP53INP1Q96A56 240 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 ZNF232Q9UNY5 417 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 ARHGAP5Q13017 1502 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 MAP3K1Q13233 1512 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 KDM5DQ9BY66 1539 aa6.29□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 ACIN1Q9UKV3 1341 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SOX11P35716 441 aa6.28□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SEMA3FQ13275 785 aa6.28□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 WASHC4Q2M389 1173 aa6.28□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 ANKLE2Q86XL3 938 aa6.28□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.28□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 C7orf43Q8WVR3 580 aa6.28□□□□□ -1.4
NOM1-202ENST00000460332 SPATA31A6Q5VVP1 1343 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 UGGT1Q9NYU2 1555 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 FGD6Q6ZV73 1430 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 ATP7AQ04656 1500 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 NEFMP07197 916 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 KCNQ4P56696 695 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 EML3Q32P44 896 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 RHPN1Q8TCX5 695 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 ZNF358Q9NW07 568 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 ANKIB1Q9P2G1 1089 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 NOD1Q9Y239 953 aa6.27□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 PREX2Q70Z35 1606 aa6.26□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 SERTM1A2A2V5 107 aa6.26□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 PSME1Q06323 249 aa6.26□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 RAB44Q7Z6P3 723 aaPredicted RBP6.26□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 SLC9A9Q8IVB4 645 aa6.26□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 CEP63Q96MT8 703 aa6.26□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 BRD7Q9NPI1 651 aa6.26□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 USP21Q9UK80 565 aa6.26□□□□□ -1.41
NOM1-202ENST00000460332 KCNH4Q9UQ05 1017 aa6.26□□□□□ -1.41
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 140 ms