RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439083.5

TNS1-208, Transcript of tensin 1, humanhuman

TSL 5

Gene TNS1, Length 538 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNS1-208ENST00000439083 VAMP4O75379 141 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 FLIIQ13045 1269 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 TTLL11Q8NHH1 800 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 JARID2Q92833 1246 aaPredicted RBP18.48■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 GGA1Q9UJY5 639 aa18.48■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP18.48■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 HIRAP54198 1017 aaPredicted RBP18.47■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 CWF19L2Q2TBE0 894 aaKnown RBP18.47■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 COL4A1P02462 1669 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 XDHP47989 1333 aa18.47■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 UFL1O94874 794 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 DOK7Q18PE1 504 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 CST9Q5W186 159 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 CDC37L1Q7L3B6 337 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 MICALL2Q8IY33 904 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 LINS1Q8NG48 757 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 PLA2G12BQ9BX93 195 aa18.46■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 BSDC1Q9NW68 430 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 ZBTB12Q9Y330 459 aaPredicted RBP18.46■□□□□ 0.55
TNS1-208ENST00000439083 TRAF5O00463 557 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 VIL1P09327 827 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 ATP2B4P23634 1241 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 ECE1P42892 770 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 FKBP5Q13451 457 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 GCKRQ14397 625 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 TRPM4Q8TD43 1214 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 DNAAF4Q8WXU2 420 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 CCDC85AQ96PX6 553 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 MYH16Q9H6N6 1097 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 WBP1LQ9NX94 342 aa18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 SALL2Q9Y467 1007 aaPredicted RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 WDR33Q9C0J8 1336 aaKnown RBP18.45■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 G3V3G9 751 aa18.44■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 EXOSC9Q06265 439 aaKnown RBP18.44■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP18.44■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 DCAF8Q5TAQ9 597 aa18.44■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 UBE3BQ7Z3V4 1068 aa18.44■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 KCNQ5Q9NR82 932 aa18.44■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 TLL2Q9Y6L7 1015 aa18.44■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 MAP2K1Q02750 393 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 PODNQ7Z5L7 613 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 FAM9BQ8IZU0 186 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 TNS4Q8IZW8 715 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 AIDAQ96BJ3 306 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 HHIPL1Q96JK4 782 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 GPR101Q96P66 508 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 GREM2Q9H772 168 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 MINPP1Q9UNW1 487 aa18.43■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 ZNF609O15014 1411 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 FOXN1O15353 648 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 CSF1RP07333 972 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 CASP7P55210 303 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 AGBL3Q8NEM8 1001 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 PRDM10Q9NQV6 1147 aa18.42■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 SHTN1A0MZ66 631 aa18.41■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 CELF2O95319 508 aaKnown RBP18.41■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 CTCFP49711 727 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 SAMD7Q7Z3H4 446 aa18.41■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 SAPCD2Q86UD0 394 aa18.41■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 CAPNS2Q96L46 248 aa18.41■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 SPINK5Q9NQ38 1064 aaPredicted RBP18.41■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 IGHMBP2P38935 993 aaKnown RBP18.4■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 LEMD3Q9Y2U8 911 aa18.4■□□□□ 0.54
TNS1-208ENST00000439083 MAP2K2P36507 400 aa18.39■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 CCT4P50991 539 aaKnown RBP18.39■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 RSBN1LQ6PCB5 846 aaPredicted RBP18.39■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 MED23Q9ULK4 1368 aa18.39■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 USP17L3A6NCW0 530 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 USP17L4A6NCW7 530 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 ITGA6P23229 1130 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 ZNF280AP59817 542 aaPredicted RBP18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 BEND3Q5T5X7 828 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 USP17L1Q7RTZ2 530 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 USP48Q86UV5 1035 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 DCPSQ96C86 337 aaKnown RBP18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 GMLQ99445 158 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 ANKRD2Q9GZV1 360 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 CACNA1FO60840 1977 aa18.38■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 TRPM7Q96QT4 1865 aa18.37■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 EGFRP00533 1210 aa18.37■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa18.37■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 CYP4F22Q6NT55 531 aa18.37■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 PAXIP1Q6ZW49 1069 aaPredicted RBP18.37■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 KRT26Q7Z3Y9 468 aa18.37■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 RBM26Q5T8P6 1007 aaKnown RBP18.36■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 ZNF521Q96K83 1311 aa18.36■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 MPHOSPH8Q99549 860 aa18.36■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 COA1Q9GZY4 146 aa18.36■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 CCER2I3L3R5 266 aa18.35■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 USP17L8P0C7I0 530 aa18.35■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 MMP14P50281 582 aa18.35■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 FAM161AQ3B820 660 aa18.35■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 ZNF804BA4D1E1 1349 aa18.34■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 ANKRD18BA2A2Z9 1011 aa18.34■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 WTIPA6NIX2 430 aaPredicted RBP18.34■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 F6X3S4 739 aa18.34■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 STRIP1Q5VSL9 837 aa18.34■□□□□ 0.53
TNS1-208ENST00000439083 SULF1Q8IWU6 871 aa18.34■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 18.9 ms