RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000436881.2

C9orf172-201, Transcript of Uncharacterized protein C9orf172, humanhuman

APPRIS P1 BASIC

Gene C9orf172, Length 4,387 nt, Biotype protein coding.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf172-201ENST00000436881 IRS4O14654 1257 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 WTAPQ15007 396 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 FAM177A1Q8N128 213 aaPredicted RBP18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 IL17REQ8NFR9 667 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 SLC26A6Q9BXS9 759 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 RAB11FIP4Q86YS3 637 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 PPP1R9BQ96SB3 815 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 UTP14AQ9BVJ6 771 aaKnown RBP18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 ATP7BP35670 1465 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 RFC4P35249 363 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 GIMAP6Q6P9H5 292 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 ACSBG1Q96GR2 724 aa18.59■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 CYP7A1P22680 504 aa18.58■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 CBX1P83916 185 aa18.58■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 CRNKL1Q9BZJ0 848 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 NEMFO60524 1076 aa18.58■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 KLHL10Q6JEL2 608 aa18.58■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 DHX32Q7L7V1 743 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 ESR2Q92731 530 aa18.58■□□□□ 0.57
C9orf172-201ENST00000436881 EYA2O00167 538 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 RUFY3Q7L099 469 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 CLASP1Q7Z460 1538 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC191Q8NCU4 936 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 ERBB4Q15303 1308 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 DNM1Q05193 864 aaKnown RBP18.58■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 PTPN14Q15678 1187 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 SETDB2Q96T68 719 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 RAB34Q9BZG1 259 aa18.58■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 MPHOSPH10O00566 681 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 SGSM2O43147 1006 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 EPB41L2O43491 1005 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 CDR1P51861 262 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 EIF5P55010 431 aaKnown RBP18.57■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC102BQ68D86 513 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 KCNG4Q8TDN1 519 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 ARAP3Q8WWN8 1544 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 PLEKHG1Q9ULL1 1385 aa18.57■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 TOP1P11387 765 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF76P36508 570 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 ZNF496Q96IT1 587 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 ALG1Q9BT22 464 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 IQGAP3Q86VI3 1631 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 KIF1BO60333 1816 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 PRC1O43663 620 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 PDCL2Q8N4E4 241 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 TTC12Q9H892 705 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 ODF2Q5BJF6 829 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 CHAMP1Q96JM3 812 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 SLC4A4Q9Y6R1 1079 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 ARHGAP29Q52LW3 1261 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 NOM1Q5C9Z4 860 aaKnown RBP18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC12Q8WUD4 166 aaPredicted RBP18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 USP44Q9H0E7 712 aa18.56■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 BIN1O00499 593 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 GCKRQ14397 625 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM63CQ9P1W3 806 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 RTL1A6NKG5 1358 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 TET3O43151 1660 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 GSDMDP57764 484 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 TIMM10P62072 90 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 KANK3Q6NY19 840 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 KAT14Q9H8E8 782 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 HECW2Q9P2P5 1572 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 TNNI3KQ59H18 835 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 DACT1Q9NYF0 836 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 IQSEC3Q9UPP2 1182 aaPredicted RBP18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 FPGT-TNNI3KV9GXZ4 949 aa18.55■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 ZSCAN12O43309 604 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 SYCP1Q15431 976 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 SHROOM2Q13796 1616 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 NOLC1Q14978 699 aaKnown RBP eCLIP18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 SSH3Q8TE77 659 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 SUCLG2Q96I99 432 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 BTG4Q9NY30 223 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 SYT1P21579 422 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 NAA16Q6N069 864 aaPredicted RBP18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 DBNDD2Q9BQY9 259 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 PYM1Q9BRP8 204 aaKnown RBP18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 HELLSQ9NRZ9 838 aa18.54■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 GIGYF1O75420 1035 aaPredicted RBP18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 GNAT2P19087 354 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 RTN1Q16799 776 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 KIF18AQ8NI77 898 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 FAM200AQ8TCP9 573 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 A0A1B0GUL7 405 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 FAM89AQ96GI7 184 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 IGF2BP2Q9Y6M1 599 aaKnown RBP eCLIP18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 MRPS27Q92552 414 aaKnown RBP18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 ARHGAP31Q2M1Z3 1444 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 BMP15O95972 392 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 SYKP43405 635 aa18.53■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 UNC13BO14795 1591 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 GSTO1P78417 241 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 CCDC96Q2M329 555 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 TMEM266Q2M3C6 531 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 HELBQ8NG08 1087 aaPredicted RBP18.52■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 E9PCH4 1651 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 KLHDC4Q8TBB5 520 aa18.52■□□□□ 0.56
C9orf172-201ENST00000436881 TPTE2Q6XPS3 522 aa18.52■□□□□ 0.55
C9orf172-201ENST00000436881 UBXN4Q92575 508 aa18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 24.3 ms