RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000425184.5

RBM39-210, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 3

Gene RBM39, Length 526 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-210ENST00000425184 ZNF211Q13398 564 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 ZNF438Q7Z4V0 828 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 SMG9Q9H0W8 520 aaKnown RBP7.39□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 ANO2Q9NQ90 1003 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 ABI2Q9NYB9 513 aaPredicted RBP7.39□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 EGFL7Q9UHF1 273 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 FAM229AH3BQW9 127 aa7.38□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 HYAL2Q12891 473 aa7.38□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 C8orf34Q49A92 452 aa7.38□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 C1QTNF9BB2RNN3 333 aa7.37□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 MSL1Q68DK7 614 aa7.37□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 CD163Q86VB7 1156 aa7.37□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 DMRTC2Q8IXT2 367 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 POLIQ9UNA4 740 aa7.37□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 ICMTO60725 284 aa7.36□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 SERPINB4P48594 390 aa7.36□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 H3BRB1 525 aa7.35□□□□□ -1.23
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RBM39-210ENST00000425184 ELNP15502 786 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 CHRNA4P43681 627 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 EHHADHQ08426 723 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 COL13A1Q5TAT6 717 aaPredicted RBP7.35□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 GLYCTKQ8IVS8 523 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 TUT1Q9H6E5 874 aaKnown RBP7.35□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 FZD6O60353 706 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 CYP2E1P05181 493 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 GDF6Q6KF10 455 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 ILDR2Q71H61 639 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 NCAPG2Q86XI2 1143 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 DTWD1Q8N5C7 304 aa7.34□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 CCER1Q8TC90 406 aaPredicted RBP7.34□□□□□ -1.23
RBM39-210ENST00000425184 A6NHS1 94 aa7.33□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 CES1P23141 567 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 GRIK4Q16099 956 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 TXNDC2Q86VQ3 553 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 FMR1NBQ8N0W7 255 aaPredicted RBP7.33□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 CNTN3Q9P232 1028 aa7.33□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 SMNDC1O75940 238 aaKnown RBP eCLIP7.32□□□□□ -1.244e-11■□□□□ 10.4
RBM39-210ENST00000425184 CACTIN-AS1Q8N1I8 211 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 C1orf127Q8N9H9 656 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 PMEPA1Q969W9 287 aa7.32□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 CCDC87Q9NVE4 849 aa7.32□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 C9orf172C9J069 976 aa7.31□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 BRD1O95696 1058 aa7.31□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 ATP11AP98196 1134 aa7.31□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 GJD3Q8N144 294 aa7.31□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 CEP120Q8N960 986 aa7.31□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 SNX29Q8TEQ0 813 aa7.3□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 RASSF4Q9H2L5 321 aa7.3□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 SALL4Q9UJQ4 1053 aa7.3□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 FAM177BA6PVY3 158 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 DEAF1O75398 565 aaPredicted RBP7.28□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 SELPP16109 830 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 MAP4K3Q8IVH8 894 aa7.28□□□□□ -1.24
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RBM39-210ENST00000425184 LACRTQ9GZZ8 138 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 USP21Q9UK80 565 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 PPME1Q9Y570 386 aa7.28□□□□□ -1.24
RBM39-210ENST00000425184 EREGO14944 169 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 PTPRAP18433 802 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 CDC27P30260 824 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 SHISA2Q6UWI4 295 aa7.27□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 FOXD3Q9UJU5 478 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 GNEQ9Y223 722 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 TNFRSF11AQ9Y6Q6 616 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 EDN3P14138 238 aa7.26□□□□□ -1.25
RBM39-210ENST00000425184 PDE3BQ13370 1112 aa7.26□□□□□ -1.25
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