RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000419364.1

SIX3-AS1-201, SIX3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene SIX3-AS1, Length 844 nt, Biotype lincRNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GMPSP49915 693 aaPredicted RBP17.04■□□□□ 0.32
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 UFL1O94874 794 aa17.03■□□□□ 0.32
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 ITGA6P23229 1130 aa16.98■□□□□ 0.31
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 MICALL2Q8IY33 904 aa16.98■□□□□ 0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCNQ5Q9NR82 932 aa16.98■□□□□ 0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCER2I3L3R5 266 aa16.97■□□□□ 0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZC3H15Q8WU90 426 aaKnown RBP16.97■□□□□ 0.31
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 FAM161AQ3B820 660 aa16.96■□□□□ 0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MPHOSPH8Q99549 860 aa16.96■□□□□ 0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PGAP2Q9UHJ9 254 aa16.96■□□□□ 0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CACNA1FO60840 1977 aa16.96■□□□□ 0.31
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SHTN1A0MZ66 631 aa16.95■□□□□ 0.3
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 C9orf78Q9NZ63 289 aaPredicted RBP16.94■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ABT1Q9ULW3 272 aaKnown RBP16.94■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 LEMD3Q9Y2U8 911 aa16.94■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MED23Q9ULK4 1368 aa16.93■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 RASSF10A6NK89 507 aa16.93■□□□□ 0.3
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 HSPA1BP0DMV9 641 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 FMR1Q06787 632 aaKnown RBP eCLIP16.93■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SAMD7Q7Z3H4 446 aa16.93■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MRPL50Q8N5N7 158 aaKnown RBP16.93■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CHMP3Q9Y3E7 222 aa16.93■□□□□ 0.3
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 VEGFBP49765 207 aa16.92■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 TBC1D10BQ4KMP7 808 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CST9Q5W186 159 aa16.92■□□□□ 0.3
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDC37L1Q7L3B6 337 aa16.92■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 GLIS2Q9BZE0 524 aaPredicted RBP16.92■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 USP17L3A6NCW0 530 aa16.91■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 USP17L4A6NCW7 530 aa16.91■□□□□ 0.3
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SIX3-AS1-201ENST00000419364 LMBR1LQ6UX01 489 aa16.91■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 USP17L1Q7RTZ2 530 aa16.91■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 AGBL3Q8NEM8 1001 aa16.91■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CDCA7LQ96GN5 454 aa16.91■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 COA1Q9GZY4 146 aa16.91■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 MYH3P11055 1940 aa16.91■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 ZNF804BA4D1E1 1349 aa16.91■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 PTPRCP08575 1304 aa16.91■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CELF2O95319 508 aaKnown RBP16.9■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KCNJ4P48050 445 aa16.9■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CHRNDQ07001 517 aa16.9■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 CCDC57Q2TAC2 916 aa16.9■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 KIF4BQ2VIQ3 1234 aa16.9■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 SSH1Q8WYL5 1049 aa16.9■□□□□ 0.3
SIX3-AS1-201ENST00000419364 EGFRP00533 1210 aa16.89■□□□□ 0.29
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